基因組研究再創佳績，轉錄因子異常背鍋小兒白血病

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《轉》譯

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一項新的研究表明，轉錄因子DUX4 和ERGde的功能異常將導致一種亞型小兒急性B淋巴細胞白血病（acute lymphoblastic leukemia，ALL）的發生。

應用基因組測序技術、RNA測序技術、染色質免疫共沉澱測序技術等前沿手段，來自華盛頓大學附屬美國聖裘迪兒童研究院兒童癌症基因組項目的研究人員完成了1900例兒童及成人急性B淋巴細胞白血病患者遺傳信息的檢測。他們發現這些白血病患者體內DUX4基因的多次重組與異構體的異常表達或刪除引起的ERG功能缺失密切相關。該研究所對應的具體論文發表於最新上線的Nature Genetics雜誌上，標題為「Deregulation of DUX4 and ERG in acute lymphoblastic leukemia。」

文章的共同作者，McDonnell基因研究所副主任丁麗（Li Ding音譯）在聲明中表示：「我們的數據顯示基因表達譜不同的白血病患者體內廣泛存在著DUX4基因的重排現象，DUX4基因重排在白血病發展早期是一種必要的克隆現象。」

既往已有研究發現在具備DUX4基因融合或缺失的腫瘤中，ERG（一種編碼轉錄因子的基因，參與血細胞的分化和調控，目前認為其與急性髓細胞白血病和前列腺癌相關）受到影響的例子。但這一潛在的急性B淋巴細胞白血病亞型尚未被完整揭示。

為了進一步了解ERG改變導致的ALL亞型，研究者對1347名患病兒童的血液樣品進行研究，其中青少年（16-20歲）395例，青壯年（21-39歲）171例。他們對所有研究對象均進行了晶元分析，對少數患者還進行了基因組、外顯子組和/或轉錄組測序。

他們發現7.6%的急性B淋巴細胞白血病患者的基因表達模式類似，1/10的青少年和兒童被視為高風險患者。研究者通過進一步研究這一潛在亞型的分子特徵發現，一半以上的研究對象中存在ERG的缺失，而所有研究對象均存在DUX4的重排。

該研究小組發現，DUX4-ERG基因突變會影響其他轉錄因子功能及轉錄變化，導致無ERG缺失的腫瘤患者中也可存在ERG副本表達異常。

研究者們猜測，在此病中發現DUX4的重排及ERG調節功能的異常絕非巧合，它們可能在急性B淋巴細胞白血病的發生髮展過程中發揮著重要作用。而CHIP測序分析表明RNX4及ERG間存在相互綁定，且過表達臍血造血細胞中的DUX4及後續實驗分析均支持這一假設。

作者註明：「不論是否存在其他預後不佳的基因突變，DUX4/ERG ALL預後較好，這些研究成果具有重要的臨床意義。但是，在染色體分析中，DUX4的基因重排並不明顯，這對基因組及RNA測序結果的分析來說是一個挑戰。」

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