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NgAgo最新文章作者:沒有支持或反駁韓春雨的論文

因為NgAgo基因編輯技術的實驗始終無法重複,河北科技大學副教授韓春雨一直處於質疑聲中。11月11日,由中國科學院主管的英文期刊《細胞研究(Cell Research)》(影響因子:14.812)在線發表了一篇題為《基於NgAgo的fabp11a基因敲低引起的斑馬魚眼睛發育缺陷》的「致編輯信」文章。


韓春雨在國際頂級期刊《自然-生物技術》上發表關於NgAgo技術的論文並引發爭議後,這是第一篇由學術期刊發表的、關於NgAgo技術的學術性文章。

NgAgo最新文章作者:沒有支持或反駁韓春雨的論文


11月11日,由中國科學院主管的英文期刊《細胞研究》在線發表了一篇題為《基於NgAgo的fabp11a基因敲低引起的斑馬魚眼睛發育缺陷》的「致編輯信」文章。據《細胞研究》發表的內容顯示,該研究的通訊作者是南通大學神經再生重點實驗室副教授劉東,研究團隊人員除了來自南通大學,還包括復旦大學生命科學學院研究員王永明。在使用NgAgo之後,雖然發現了NgAgo的其他特性,但並沒有發現任何基因編輯的現象。


該文章顯示,研究團隊在斑馬魚的細胞中使用NgAgo技術後,斑馬魚的眼睛發育出現了缺陷,疑似發生了基因編輯。但是進行測序後才發現,基因組層面上或者說DNA層面上,沒發生任何編輯。進一步,他們檢測發現,只是mRNA表達量上發生了改變。這意味著引起發育缺陷的原因是基因敲低,而不是基因編輯。


什麼是基因敲低,什麼是基因編輯?

這要從生命體的運轉流程說起。DNA是負責引導生物發育與生命機能運作的「司令」,但具體的生物功能都由蛋白質來執行。所以,DNA需要先轉錄成為RNA,再通過RNA翻譯成蛋白質。這個過程稱為基因表達,其中,RNA充當了中介的角色。


如果通過人為的方式,對RNA這個中介進行干擾,使得基因表達降低,只能完成一小部分的基因表達,讓蛋白質無法正常工作,我們就將這一現象稱為「基因敲低」。如果是對DNA這個發號「司令」進行變動,使得基因的序列發生變化,那是更高級別的干預,會完全改變基因表達,我們稱為「基因編輯」。


韓春雨在5月2日發表的論文認為,NgAgo技術可以實現「基因編輯」,而劉東等人的這篇文章提供的結論是,NgAgo技術並沒有實現「基因編輯」,實現的是「基因敲低」或者說「基因表達降低」。


這個研究結論意味著什麼?是支持還是反駁了韓春雨發表的NgAgo論文?


今年6月,就在韓春雨發表論文後一個月,王永明和合作者就開始研究NgAgo技術,在大約做了一個月時間的實驗後,他們發現了NgAgo這個不同於「基因編輯」的特性。

「結果剛出來的時候還沒有質疑聲,他在這麼高水平的雜誌上發表了文章,我們很想拿過來用一下,用完之後我們確實在魚身上看到了『表型』,所以我們很高興,覺得在魚裡面確實能編輯基因。然後我們就進一步研究,想看看編輯完後DNA上有啥改變。但是一檢查發表DNA上沒有改變。然後我們又檢測了RNA,發現RNA的表達下調了。所以基於這個結果,我們就做了這篇文章。」王永明說,「從基因編輯的角度上來看,這(註:指的是通過NgAgo技術看到突變的表型)是一個假陽性。」


對於為何NgAgo有基因表達降低的功能,該研究團隊在文章里提出猜想:NgAgo是通過結合到目標基因上,阻止了基因轉錄成RNA,無法翻譯成蛋白,使得基因的功能發揮不出來。


中科院動物研究所研究員王皓毅、中科院上海生科院神經科學研究所研究員楊輝看完文章後表示,這篇文章與他們之前的實驗結論並不矛盾,也沒有檢測到基因組的定點突變,但是對於使用NgAgo技術會出現基因表達降低這一現象,文章雖然對此提出了可能的機制,但沒有更深一步的探討。


10月10日,包括王皓毅、楊輝在內的13位中國生物學家實名發聲,表示在對NgAgo技術多次進行重複實驗或驗證後,無法支持韓春雨的結果,呼籲有關部門啟動學術調查。


王永明向澎湃新聞解釋,這次發在《細胞研究》上的文章屬於「Letter(信)」,並非「Article(論文)」,這也是他們選擇向《細胞研究》而不是《自然》系列期刊投稿的原因。

「因為當時我們做出來的結果不多,所以在《Cell Research》上有那種letter性質的文章,只需要一個figure(數據圖),需要的結果比較少。所以我們覺得發在這上面更適合。如果你要想發在《Nature》系列上的話,需要做好幾個figure(數據圖),需要大量的工作,所以我們覺得投在這上面比較合適一點。」王永明說:「我們有很多數據來支持這個結果,但是呈現在文章上的時候就一個figure,一個圖,但也是分abcd很多小的圖片。」


王永明表示,自己沒有和韓春雨交流過,「發表文章只想發表這個結果,不想討論這個結果有效還是無效」


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