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昆明動物所發現裸鼴鼠的抗癌特性與長鏈非編碼RNA密切相關

昆明動物所發現裸鼴鼠的抗癌特性與長鏈非編碼RNA密切相關



裸鼴鼠(Heterocephalus glaber)是嚙齒類動物中名副其實的長壽之星,其壽命可長達30年,而一般小鼠及大鼠的壽命僅有2~3年。此外,裸鼴鼠還具有天然的抗癌特性,因此裸鼴鼠在長壽和腫瘤研究領域受到極其廣泛的關注。長鏈非編碼RNA(LncRNA)被定義為長度大於200bp而不具備編碼蛋白潛能的轉錄本,過去認為lncRNA只是基因組中的「junk DNA」,如今發現lncRNA不僅能精確調控發育和基因表達,更是與諸多老年疾病(如老年痴呆、腫瘤等)的發生息息相關。在過去,由於技術的限制以及lncRNA序列在物種間呈現低保守性等原因,lncRNA的鑒定和分析都存在較多的困難。然而,二代測序技術以及生物信息學的快速發展使得我們可以快速、準確地挖掘不同物種的lncRNA序列,並對其功能進行有效的預測。

孔慶鵬課題組以裸鼴鼠為研究對象,建立了一套嚴格的lncRNA鑒定流程,從裸鼴鼠基因組中成功鑒定出4,422條高質量lncRNA,並發現裸鼴鼠的lncRNA具有表達丰度低、組織特異性強及保守性低等特點;通過共表達分析對裸鼴鼠的lncRNA功能進行預測,發現大約61.93%的裸鼴鼠lncRNA與抑癌基因表達高度相關。進一步分析發現,裸鼴鼠的lncRNA與透明質酸相關基因存在較高的共表達關係,而透明質酸已被證實是裸鼴鼠具備抗癌特性的關鍵物質。該結果提示,裸鼴鼠的lncRNA可能通過調控透明質酸的生成,使得其擁有天然的抗癌特性。


該項目得到了科技部「973」項目、國家自然科學基金及中科院等研究基金項目的支持。

昆明動物所發現裸鼴鼠的抗癌特性與長鏈非編碼RNA密切相關


通過lncRNA的位置信息來預測裸鼴鼠差異表達lncRNA的功能(生物谷Bioon.com)


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