加拿大研究人員開發出DNA條形碼新技術

加拿大研究人員開發出DNA條形碼新技術

出國留學網2016-12-07

近年來，DNA條形碼技術使科學家開展高並行試驗(許多不同類型的細胞在同一試管內進行試驗)成為可能，而新一代DNA測序技術的發展，進一步提高了對條形碼計數和讀取結果的效率。

然而，可在同一試管內進行的試驗次數，卻受限於編碼的細胞類型數量。一直以來，DNA條形碼都是一維的，也就是一個條形碼只能做一次試驗。允許條形碼在細胞內融合在一起，意味著科學家們現在可以打破這一障礙。新技術可顯著提高在單一試管內進行的實驗次數，在同等成本條件下能將效率提高10倍。

在廣泛使用的酵母雙雜交(Y2H)方法中，攜帶一個「誘餌」蛋白的酵母細胞與攜帶一個「獵物」蛋白的酵母細胞配對。對Y2H系統進行操縱後，只有「誘餌」與「獵物」蛋白黏在一起的細胞才能存活，從而使科學家可以觀察到哪些蛋白間互相關聯。在被命名為「條形碼融合遺傳學—酵母雙雜交(BFG-Y2H)」的新技術中，攜帶著數千「誘餌」和「獵物」蛋白的細胞在同一培養皿中配對。

BFG-Y2H方法的新穎之處在於，通過對細胞編程，將來自「誘餌」和「獵物」細胞的DNA條形碼連接在一起，形成一個「融合條形碼」，然後利用新一代DNA測序方法對融合條形碼進行檢測。

研究人員稱，這項研究的最終目標，是建立蛋白相互作用網路的三維視圖，而不是靜態圖。通過有效建立含有更豐富信息的蛋白相互作用圖譜，BFG-Y2H方法可拓展研究人員對細胞工作機理的理解，並展現只在某種特定環境條件下才能發生的蛋白相互作用，從而加速對基因功能和人類疾病的理解。