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Western Blot實驗中那些炫彩表象下的本質

Western Blot實驗中那些炫彩表象下的本質



作者:解螺旋·毛博

如需轉載請註明來源:解螺旋·醫生科研助手


導語


Western blot實驗是很常用的一種實驗,常用於定量或者定性確定組織或者細胞中蛋白質的表達情況。這裡和大家分享一下毛博做Western的心得體會,更有經典的protcol獻上。除了心得體會,還有Western常見問題,以及可能原因分析。都是滿滿的乾貨喲。


參考文獻選一抗

做Western blot實驗,一抗非常非常重要。如果一抗選擇的不好,神仙也做不出來Western。進口的抗體太貴;國產的抗體不好用。進口抗體一般不會出現問題。市場上知名的幾家公司,包括ABCAM,Sigma,CST,Santa Cruz等公司,質量都不錯。進口抗體國內分裝和國產抗體,質量實在不敢恭維。讓人已經無力吐槽。


抗體的選擇,毛博有個百試不爽的竅門。那就是——文獻大法。找一些你的專業方向的經典文獻。然後,看文獻裡面是不是和你的實驗用的是同樣的組織同樣的細胞,看文獻裡面的Western blot的條帶清不清楚,邊緣銳利不銳利,最後看文獻裡面用的是哪個公司的抗體。直接購買即可。


Western Blot實驗試劑選擇


毛博我是按ABCAM公司的經典protocol做的。這裡給大家提供一個網址,以供下載(http://www.abcam.com/ps/pdf/protocols/WB-beginner.pdf)。


抗體的說明書大家要仔細看。不同的抗體公司推薦的配置的方法是不一樣的,比如CST的gamma-H2AX抗體需要用脫脂奶粉配置,而有些公司卻要求用BSA配置。

封閉用的奶粉看似簡單,其實很重要。如果要湊合,可以到超市買光明牌脫脂奶粉。但是不建議這麼做。因為封閉要在室溫下過夜的,如果是夏天的話,第二天過來都變成酸奶了。還怎麼接著往下做實驗呀。其實現在,一般實驗用專門封閉的奶粉也不貴。一大罐可以用很久了。

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內參抗體的選擇


在Western blot實驗中,用的最多的是內參抗體。作為重要的參照系,只要一開始做Western,不管什麼蛋白質,肯定要用內參抗體。這裡,毛博強烈推薦GAPDH。國外大牌雜誌上發表的牛論文一般都是用的GAPDH。大牛實驗室都用的,肯定錯不了。毛博推薦Minipore公司的。因為確實好用。

以上和大家分享了毛博做Western的三點經驗體會。下面再談談新手在做Western的時候,會遇到的常見問題和可能的原因。


空空如也,轉完膜沒條帶怎麼辦


新手在做Western的時候,有時候轉完膜後,膜上面沒有任何條帶,白茫茫一片大地真乾淨!這又是什麼原因呢?


這個時候,最大的可能就要考慮是不是膜裝反了。不要笑哈。這其實是新手最容易犯的錯誤。膜反了,直接就沒有轉上去。如下圖所示,要把夾子的黑面對著轉移槽的黑面;夾子的白面對著轉移槽的紅面。

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暗夜流星,片子熠熠生輝是好事嗎?


新手在做Western的時候,有時候會走向另外一個極端,整張片子都熠熠生輝。像划過暗夜的流星,茫茫大海的燈塔一樣。但是,這不是指引你走向成功和勝利哈。而是指引你走向失敗和延期畢業。

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這種情況,一般是二抗的濃度太高了。導致和一抗結合的二抗太多了,或者加了二抗孵育之後,洗得時間不夠長,洗不幹凈,導致整個膜上面都結合上了二抗。解決辦法就是稀釋二抗,好好洗白白。二抗稀釋多少倍才合適呢?這個要靠摸條件,1:1000,1:2000,1:4000,幾個梯度都試一試。


別以為「有背景」都是福!


在中國這個社會,做人有背景有資源有靠山,是一件好事;做Western有背景,可是一件壞事哈。看看下面這個圖,黑乎乎的,難看死了。曾經發生過老闆將這種膜直接扔下樓,然後讓研究生下去撿上來的慘劇。

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發生這個情況,一般都是封閉沒有封閉完全,或者漂洗沒有漂洗乾淨的問題。封閉的話,5%脫脂牛奶或者BSA 4°C過夜。漂洗的話,室溫下至少1小時,用脫色搖床多震蕩。


毛博最後再嘮叨一句,Western實驗是一個需要耐心和細緻的實驗。每一個步驟都要小心翼翼,注意細節。

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