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Cell公布人類蛋白組裡程碑式進展

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7月21日Cell上在線報道了美國系統生物學研究所和蘇黎世聯邦理工大學等一批院校合作開發人類SRMAtlas定量蛋白組的研究計劃。人類SRMAtlas研究計劃是為了對預測的人類蛋白組中任何蛋白實現靶向鑒定和可再生定量,而進行的高度特異性的質譜檢測。其中包括剪接變異體檢測,非同義突變和翻譯後修飾。所使用的技術稱為選擇性反應監測,是用了166174個特徵明確,化學合成的肽段而發展起來的分析技術。

SRMAtlas定量蛋白組的意義


雖然人類基因組在2003年的已經完成了,並創建了所有人類基因的清單。但大多數蛋白質的研究仍然集中在同一個相對較小的,在人類基因組圖譜繪製之前就研究的子集中。為了促進這個停滯的蛋白基因組的研究,為基本上每一個人類蛋白開發高度特異性的分析是必要的。

Cell公布人類蛋白組裡程碑式進展


SRMAtlas定量蛋白組可以實現的功用


在美國的系統生物學研究所Robert Moritz教授的實驗室,他們通過合作的努力,產生和驗證了一個特殊的有針對性的蛋白組學分析方法,稱為選擇性反應監測或者簡稱SRM。通過選擇性檢測特定母離子和子離子來排除非目標組分的干擾,增強了檢測靈敏度和定量準確度。現在可以通過廣泛使用的、敏銳的和很強針對性的質譜方法的選擇性反應監測,為20277個已經注釋的人類蛋白質的97% 提供定量作用。人類SRMAtlas提供明確的分析歸類,最後在生物樣本中確鑿地鑒定相應的蛋白。


作為人類SRMAtlas這樣一個資源,檢測任何蛋白的前景現在成為了現實。現在人類SRMAtlas提供了基於選擇性反應監測技術的已驗證質譜,為人類蛋白組學的每個基礎蛋白提供了一個統一的過程。這些分析可以快速地在系統生物學和生物醫藥研究中實施,以高靈敏度和高選擇性來確定和量化任何人類蛋白質,並將其定位到完整的蛋白圖譜來研究它們的生物學功能。


個性化醫療將運用分子標記來監測健康狀況,並提供信號來鑒定健康狀況下的變化,並且為將對的病人匹配到對的藥物提供信息。人類SRMAtlas主動推動了蛋白組學進入前沿,為蛋白組在全球範圍越來越努力的癌症登月計劃中起重要作用提供了進一步的推動力。


備註:本文編譯自phys和ScienceDaily 網站的Quantitating the complete human proteome

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