沒有想像中那麼深奧——基本概念篇
藥物基因組學的研究對象是與藥物在體內吸收、轉運、代謝和作用等相關的基因,通過研究各種基因與藥效和安全性之間的關係,為臨床藥物治療提供更加豐富的信息。這是 20 世紀九十年代末發展起來的一門基於分子藥理學與功能基因組學的新興學科 [1]。
現將其相關基本概念介紹如下 [2]:
基本概念篇
一、基因與基因型
基因:遺傳物質的最小功能單位,是指具有一定生物學意義的一段 DNA。
基因型:又稱遺傳型,是某一生物個體全部基因組合的總稱,它反映生物體的遺傳構成,即從雙親獲得的全部基因的總和。據估計,人類的結構基因有 3 萬個。
二、基因組生物標誌物
是一種可用於指示正常生物學過程、病理過程和/或對治療及其他干預措施反應性的可測量的 DNA 或 RNA 特性。
其中 DNA 的特性可包括但不僅限於單核苷酸多態性、短序列重複次數多態性、單倍型、DNA 修飾如甲基化、核苷酸的插入/缺失、拷貝數變異及細胞遺傳學重排如轉位、重複、缺失或反轉。
這些特性又包括但不僅限於 RNA 序列、RNA 表達水平、RNA 處理過程(如剪接和編輯)、微小 RNA。
三、單核苷酸多態性(SNP,
Single Nucleotide Polymorphism)
是指由單個核苷酸—腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)或胞嘧啶(G)的改變而引起的 DNA 序列的改變,造成包括人類在內的物種之間染色體基因組的多樣性。
四、等位基因
一般是指位於一對同源染色體相同位置上控制某一性狀的不同形態的一對基因。
純合子:若成對的等位基因中兩個成員完全相同,則該個體對此性狀來說是。
雜合子:若兩個等位基因各不相同,則該個體對該性狀來說是。
五、突變(Mutation)
是細胞中 DNA 核苷酸序列發生了穩定的改變。
六、融合基因(Fusion Gene)
是指兩個基因的全部或一部分的序列相互融合為一個新的基因的過程。融合基因的表達產物為融合蛋白。
七、基因表達(Gene Expression)
是基因中的DNA 序列生產出蛋白質的過程。
步驟從DNA 轉錄成mRNA 開始,一直到對於蛋白質進行翻譯後修飾為止。
八、基因擴增(gene amplification)
為一特異蛋白質編碼的基因的拷貝數選擇性地增加而其它基因並未按比例增加的過程。
九、DNA 甲基化(DNA Methylation)
為 DNA 化學修飾的一種形式,將甲基添加到 DNA 分子上,例如在胞嘧啶環的 5 碳上。DNA 甲基化能在不改變 DNA 序列的前提下,將 DNA 甲基化狀態遺傳至下一代細胞或個體。
十、聚合酶鏈反應(PCR,
Polymerase chain reaction)
簡稱 PCR 技術,是一種體外擴增特異 DNA 片段的技術,應用該技術可以在短時間內將一個或幾個 DNA 拷貝擴增到百萬數量級。
十一、熒光定量(PCR)
通過應用熒光染料或熒游標記的特異性探針,對聚合酶鏈反應產物進行標記跟蹤,實時監控反應過程,結合相應的軟體可以對熒光信號進行分析,實現基因檢測的定性和(或)定量分析。
十二、熒光原位雜交(FISH,
Fluorescent in Situ Hybridization)
是一種細胞遺傳學技術,可以用來對核酸進行檢測和定位。熒游標記的核酸探針只與具有高度相似性的核酸雜交,可用於染色體上基因的定位和定量。
十三、基因晶元
將大量(通常點陣密度 >400/cm2)的核酸探針分子固定於支持物上並與標記的樣品分子進行雜交,通過檢測每個探針分子的雜交信號強度進而獲取樣品分子的數量和序列信息。
參考文獻
[1]隋忠國,孫加琳,荊凡波,等.藥物基因組學助力個體化用藥水平[J]. 醫藥導報,2015,8(34)增刊:46-48.
[2]藥物代謝酶和藥物作用靶點基因檢測技術指南(試行).國家衛生計生委醫政醫管局,2015年7月29日.
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作者:邱凱鋒、王瑩
審核:伍俊妍
編輯:魯雨心
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