精準又高效!NGS免疫新產品出色超乎你的想像!
不久前微信的啟動頁面經歷了一次短暫的變動,傳說中的黑色神秘人遙望的不再是人類起源地非洲大陸,而變為了華夏大地上空雲圖。據小編了解微信啟動頁6年來的首次「變臉」其實是為了慶祝「風雲四號」取得的巨大突破並向億萬微信用戶展示華夏大地的河山風貌。時臨國慶佳節,這一突破無疑是獻給祖國母親最好的禮物。
「風雲四號」新一代衛星是國際上首次以一顆衛星實現了兩顆衛星的功能,是我國氣象領域的一項重大成就。而小編接下來向大家介紹的賽默飛新一代測序(NGS)的基因組分析方案也是以其優秀的檢測能力在行業內獲得了眾多專家的認可。
利用個體的自身免疫系統推動腫瘤精準醫學和個體化治療是當前科學家熱點研究的癌症治療策略之一。然而,腫瘤-免疫之間的複雜相互作用需要多種途徑來促進和推動轉化研究和結果分析。基於新一代測序(NGS)的腫瘤免疫學解決方案有望成為推動轉化和臨床研究重大發現的全新工具。
新一代測序腫瘤免疫學解決方案
利用Ion Torrent新一代測序long-read Assay發揮免疫組庫測序的威力
利用高通量測序分析免疫組庫以獲得T細胞受體基因重組的多樣性,可幫助研究者取得腫瘤免疫學研究的重大進展。
Ion AmpliSeq Immune Repertoire Assay Plus, TCR beta通過對T細胞受體β鏈重組的測序,來測定T細胞的多樣性和克隆擴增,能夠高精度地有效捕獲全部TCRβ鏈(CDR1, CDR2, CDR3)三個互補決定區域。可實現預測或預後生物標誌物的發現、T細胞表徵和可變區基因多態性的鑒定等重要應用。該Assay使用新開發的基於Ion S5和Ion S5 XL平台的長片段讀取測序技術。
Ion AmpliSeq Immune Repertoire Assay Plus, TCR β為研究者提供了一種研究細胞免疫學、快速讀取長片段的有效工具。
綜合解決方案包括:
1.發現免疫應答生物標誌物——準確測定T細胞免疫組庫的多樣性和克隆擴增,鑒定抗原-特異性T細胞,促進轉化研究。
2.優化潛在治療性T細胞的功能和生產——識別TCR β鏈序列,優化基因工程T細胞。3.研究免疫介導的不良反應(IMAEs)的標誌物——分析所有3個互補決定區域(CDR1, CDR2, CDR3)由於等位基因特異的多態性,可能與自身免疫疾病和IMAEs相關。
4.數據安全性——您可完全控制您的數據(無服務模式和附加費用)且保證分析透明度。
5.高準確性高靈敏度——以RNA作為起點,您無須擔心TCR β鏈基因產生的重組,且可從Ion S5的低置換錯誤率中獲益。
6.樣品需求量低——僅需10 ng–1 μg樣品即可構建AmpliSeq文庫。
從複雜到簡單—僅僅需要兩天
基於可靠和廣泛引用的lon AmpliSeq技術,我們精心設計的NGS解決方案可顯著提升您的turnaround time ——從RNA分離到結果分析不超過48小時(圖1)。Ion AmpliSeq Immune Repertoire Assay Plus, TCR β,可讀取長達400 bp擴增子長度,用於完整分析CDR1、CDR2和CDR3(圖2)。
圖1.工作流程 手動構建文庫,使用Ion Chef系統製備模板,使用Ion S5系統測序,使用Ion Reporter Software數據分析。
圖2. 柱狀圖表示樣品中可變基因情況。顏色區段表示特定可變等位基因頻率。已鑒定的等位基因的IMGT annotation 在X軸上標註。