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分子生物實驗的得力助手-NCBI

NCBI(National Center for Biotechnology Information)是指美國國立生物技術信息中心,是一種科研信息資料庫。其功能強大到包括日常檢測工作中PCR引物設計、靶序列的選擇,以及分子鑒定結果相似性分析等相關的DNA序列分析的工作都離不開NCBI。

在此,小編為大家介紹這具有強大功能信息資料庫。

一、NCBI的創建目的

NCBI 創建主要有以下幾個任務:

一是為儲存和分析分子生物學、生物化學、遺傳學知識創建自動化系統;

二是從事研究基於計算機的信息處理過程的高級方法,用於分析生物學上重要的分子和化合物的結構與功能;

三是促進生物學研究人員和醫護人員應用資料庫和軟體;

四是努力協作以獲取世界範圍內的生物技術信息。

二、NCBI資料庫的收錄範圍

NCBI檢索系統收錄了許多基因序列和蛋白序列資料庫,此外還提供MENLING資料庫的檢索。其中GenBank資料庫是NCBI檢索系統中主要的基因序列資料庫。該資料庫收錄了1981年至今的各國科學家直接提交註冊的基因序列、各種科技期刊論文中報道的基因序列和各種專利中公開的序列。

NCBI官網

另外,NCBI還收錄了日本基因序列資料庫DD-BJ、歐洲基因序列資料庫EMBL以及SWISS-PROT、PIR、PDB等蛋白序列資料庫。NCBI還對系統收錄的眾多資料庫進行了整合,為用戶提供了集成程度非常高的檢索工具,可以使用戶方便實現多個資料庫集成化大規模檢索。

三、NCBI系統提供的檢索功能

NCBI提供了許多基因序列相關資料庫和集成化的檢索工具,如下表,使用者可以根據自己的需要在主頁上選擇。

NCBI提供的檢索功能除了上面這些之外,還有人類孟德爾遺傳(OMIM)、三維蛋白結構的分子模型資料庫(MMDB)、人類基因序列集成(UniGene)、人類基因組基因圖譜(GMHG)、生物門類(Taxonomy) 等資料庫。


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