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《細胞》:拍案叫絕!MIT合成生物學大牛利用「基因電路」定位癌細胞並激活免疫系統,開闢免疫治療新方法|奇點猛科技

壞人一般不會把「壞」字寫在臉上。癌細胞也是。

壞人不僅不會把「壞」字寫在臉上,還會釋放各種煙幕彈,製造自己是好人的假象。癌細胞也是。

這是當下大熱的免疫檢查點抑製劑和CAR-T治療只對有限的癌症患者有效的原因之二。如何解決這兩個問題,也是當下免疫治療領域研究的熱點。

MIT電氣工程和計算機科學學院與生物工程學院副教授,素有「合成生物學領域思想家」的盧冠達(Timothy K. Lu)博士團隊最近也在思考也這個問題。在他們看來,無論癌細胞外表再怎麼光鮮,再怎麼像正常細胞,它們的內心肯定是邪惡的。既然免疫細胞「看臉」不能很好的識別癌細胞,那麼我們就把癌細胞的黑心掏給免疫細胞看。

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「合成生物學領域思想家」、跨界達人盧冠達(Timothy K.Lu)

於是,盧冠達藉助自己的合成生物學思想,設計了一個可以通過病毒進入癌細胞內部,並識別癌細胞邪惡內心的「基因電路」。這個基因電路很特殊,在那些控制只在癌細胞內的基因表達的轉錄因子的刺激下,迅速開啟,產生大量免疫信號因子,激活免疫系統,招募免疫細胞殺敵

通俗的說,就是盧冠達團隊設計的這個基因電路,不僅能夠專門識別癌細胞,而且在識別癌細胞之後還會「大聲叫喊」,叫醒免疫系統,喊來免疫細胞

奇點糕「吹」得這麼牛,到底有沒有很厲害啊?我們科學家都用實驗說話!在對卵巢癌模型小鼠進行的實驗中,基因電路取得了非常好的效果,與對照組小鼠相比,實驗組小鼠體內的癌細胞幾乎全被消滅了而且如同理論,正常細胞絲毫沒有受到影響

這簡直就厲害了!確實厲害。近日,頂級期刊《細胞》雜誌就刊登了盧冠達團隊的這一重要研究成果[1]。

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左:不處理的卵巢癌小鼠

中:增加了癌症特異性抗原的卵巢癌小鼠

右:使用基因電路的卵巢癌小鼠

同時,這種基因電路採用了模塊化的設計,就像樂高積木一樣,可以根據實際需求替換關鍵元件。這意味著它不光能隨時「升級換代」,換個識別標記就能用來治療其他癌症甚至免疫疾病,簡直萬能!

確實很厲害啊,那基因電路到底是什麼呢?

大家在初中物理一定都學過簡單電路,開關控制著小燈泡的明滅。所謂的「基因電路」倒不是真的電路,它是一組按照一定邏輯編輯的基因,分為「開關」——啟動子(promoter)和「燈泡」——工作元件(circuit component)。這些工作元件一般來說是一些編碼蛋白質的基因。當達成某些條件,這組基因電路的啟動子被激活,調控工作元件表達,就能夠實現研究者想要的生物功能。

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理科生們,看這題你們還會嗎

看上去也沒啥特別的啊,不是早就有研究者做出了能靶向癌細胞的基因電路了嗎[2]?盧冠達團隊帶來的這個基因電路優秀之處在於,一是利用轉錄因子對癌細胞進行識別,更加精準、應用更加廣泛;二是,這是首次把基因電路用在增強免疫反應上

奇點糕之前曾經介紹過盧冠達,這位年紀輕輕已經站上合成生物學領域高點的80後男神,目前是麻省理工學院合成生物學研究小組負責人。他擁有著計算機、電氣工程、合成生物學、醫學多方面的知識背景,或許正是得益於這種廣闊的視角,他才能大膽地玩跨界,而且屢屢獲得成功。

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男神對生物膜也特有研究

在理想條件下,免疫治療應該識別那些只表達在癌細胞表面的細胞表面抗原,以免誤傷正常細胞,但實際上,這種高專一性的抗原非常難找[3]。除此之外,腫瘤還會利用一些特殊的位點(例如PD-1)來抑制免疫反應,大模大樣地逍遙法外。

現在臨床上常常使用一些具有免疫調節作用的因子,例如細胞因子、趨化因子和免疫檢查點抑製劑,來增強免疫系統的功能,以期望能翻越這兩座大山。但是這又帶來了另外的問題——免疫系統的功能是增強了,但也對一些意料之外的新位點產生了作用,連健康的組織也一併幹掉了,這在臨床實驗上導致了嚴重的副作用[4,5]。

於是盧冠達副教授就想啊,要是能找到新方法,簡單快捷地抓住癌細胞的同時,直接在它身上產生免疫調節因子,這些問題不就都解決了嗎。

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諸位讀者還真別笑這個想法是「給貓系鈴鐺」,基因電路可不就實現它了嘛。

大家都知道,癌細胞瘋狂增殖,它們的基因表達水平是遠超正常細胞的。抓住了這個特點,盧冠達團隊把轉錄因子(TFs)作為癌症的標誌物,設計了能識別它們的啟動子。比起找個癌細胞表面抗原,找特定癌細胞的轉錄因子可容易多了。

為了更精準地識別癌細胞,研究者在基因電路上安裝了兩個不同的啟動子,做了一個「與門」結構。只有兩個啟動子都認為「有腫瘤!」,整個基因電路才會運作。

從理論上來看,這套基因電路對健康細胞毫無威脅,對癌細胞卻是滅頂之災。因為一旦發現了癌細胞,基因電路運作,就會產生多種免疫因子,激活免疫系統,把癌細胞「一窩端了」。說到這裡,奇點糕就要感嘆一下盧冠達副教授的思慮縝密。這套基因電路能產生的因子包括:表面T細胞結合子(STE),一種細胞表面抗原,是癌細胞的特異性識別位點;趨化因子21(CCL21),可以促進T細胞在癌細胞位點聚集;白介素12(IL12),一種可以增強T細胞活性和功能的細胞因子;PD-1抗體,能夠降低癌細胞對免疫系統的抑制。

任你癌細胞再怎麼狡猾,這四種免疫激活因子分別作用於免疫反應的不同環節,全方位圍剿壞蛋。

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兩個啟動子都識別到腫瘤標誌物,基因電路啟動,釋放多種免疫激活因子,吸引免疫細胞聚集、促進對癌細胞的殺傷、避免免疫抑制,這種過程對健康細胞毫無傷害

「我們認為,現在首要的是對腫瘤位點進行精準的免疫打擊,而不是對整個機體系統的治療,」盧冠達副教授如是說,「其次,我們想要一次性產生多種免疫調節劑,這樣能夠從多種角度調節免疫系統。」

在體外、體內實驗中,研究者們確實也達到了預想的效果。結果顯示,基因電路能夠「分辨」癌細胞和健康細胞,引導免疫系統精準攻擊癌細胞,毫不影響其他非致癌性的健康細胞,對癌細胞的殺滅效果也非常好

奇點糕都興奮起來了!這簡直太厲害了啊!研究者們倒是很冷靜地表示,這項研究還有很多不足的地方,主要是實驗中使用到的癌細胞和T細胞都來自人類,宿主則是小鼠,這在一定程度上限制了對安全性和有效性的評價。不過他們已經定好了下一步目標,將在其他幾種模式動物上重複實驗,以得到更可靠的數據。

另外就是實驗中使用了慢病毒作為基因電路的載體,只有15%的癌細胞中有正常工作的基因電路。將來他們會嘗試其他的載體,提高轉化效率,如溶瘤病毒(其實奇點糕想說,15%就能有這麼好的療效,再優化一下豈不是要上天)。

目前盧冠達團隊進行了卵巢癌相關的實驗,還成功合成了乳腺癌相關的啟動子。研究者表示,他們計劃在一系列癌症中測試基因電路的威力,最終還有希望使用基因電路治療其他免疫相關疾病,如風濕性關節炎、炎症性腸病和其他自身免疫性疾病。

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參考資料:

[1]http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(17)31143-1

[2] Liu, Y., Zeng, Y., Liu, L., Zhuang, C., Fu, X., Huang, W., and Cai, Z. (2014). Synthesizing AND gate genetic circuits based on CRISPR-Cas9 for identification of bladder cancer cells. Nat. Commun. 5, 5393.

[3] Klebanoff, C.A., Rosenberg, S.A., and Restifo, N.P. (2016). Prospects for gene-engineered T cell immunotherapy for solid cancers. Nat. Med. 22, 26–36.

[4]Lasek, W., Zagozd_ zon, R., and Jakobisiak, M. (2014). Interleukin 12: still a _promising candidate for tumor immunotherapy? Cancer Immunol. Immunother.

63, 419–435.

[5]Lengyel, E., Burdette, J.E., Kenny, H.A., Matei, D., Pilrose, J., Haluska, P.,Nephew, K.P., Hales, D.B., and Stack, M.S. (2014). Epithelial ovarian cancer experimental models. Oncogene 33, 3619–3633.

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