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資訊-電子顯微鏡揭開果蠅腦部神經元的「神秘面紗」

Janelia 的兩個科學家團隊日前已經獨立繪製出關於黑腹果蠅(Drosophila melanogaster)在幼蟲和成年生活階段記憶和學習的大腦區域,他們發現了一些意想不到的突觸,或者說是神經連接。

包括Kenyon細胞(黃色)蘑菇體輸出神經元(紫色)和多巴胺能神經元(綠色)的成體飛蠅蘑菇體內神經元

Janelia的組長、神經生物學家Albert Cardona表示,此項結果強調了深入詳細的腦圖測量的必要性,我們是使用高解析度電子顯微鏡(EM)來做到的。他說,「科學家們利用高解析度電子顯微鏡,可以在大腦中研究得最深入的部分看到更多的事物。」

卡多納及其同事以及Janelia的FlyEM項目團隊和合作者最近發布了兩項獨立的研究:2017年8月10日在Nature上發表,另一項在2017年7月18日在eLife上發表,詳細介紹了新發現的神經連接及其與行為。

Janelia執行董事Gerry Rubin說:「這個大腦區域已經被選中來研究了幾十年,人們已經描述出了主要的電路。「這些模型都很整齊。

科學家研究飛行學習和記憶的神經基礎已經40多年了,且使用光學顯微鏡來描繪涉及大腦的區域。Rubin說,這種技術跟電子顯微鏡捕獲神經細胞的原理不同。EM更費時間,但好處是可以提供更多的成像細節。

Rubin比較了連接組學(即大腦突觸的映射)到人類基因組測序早期的EM的現狀。魯賓作為果蠅基因測序的先驅,他回憶在加州大學伯克利分校HHMI研究員任職期間,「一些科學家最初迴避測序工程。」他說,「他們把信息和深度細節作為一種負擔,而不是一種機會」。現在類似的爭議也滲透到了連接組學 (Connecto Mics)領域:電子顯微鏡領域是否值得額外的努力?或者,科學家們能否繼續依靠經過驗證的光學顯微鏡?

現在,考慮到Cardona和FlyEM的新研究,這些團隊認為EM應該屬於理解「飛行大腦」的關鍵方面。

這兩個小組的論文都是繪製整個果蠅神經系統,這些研究採用了兩種不同的EM方法:成人的透射電子顯微鏡(TEM)和成人離子束掃描電子顯微鏡(FIB-SEM),以及幫助理解神經元大量纏結的專業軟體。這兩項研究的目標都是蘑菇體,也就是負責聯想學習的大腦區域(想想巴甫洛夫的狗,我們將鈴鐺戒指與美味的食物聯繫在一起)。

蘑菇體由多個隔間組成,其中三個組成成人的「阿爾法」。FlyEM在這個區域進行了調整,共繪製了983個神經元。卡多納的方法略有不同。幼蟲神經系統中的神經元比成年蒼蠅小,所以他能夠追蹤幼蟲蘑菇體的300個神經元。

令人驚訝的是,FIB-SEM揭示了三類從未見過的蘑菇體突觸,這在幼蟲和成蟲中都觀察到。這些突觸連接形成三種神經元類型:肯揚細胞,報告感官信息; 多巴胺能神經元,提供關於感覺信息的細節; 並輸出神經元,這些神經元傳遞蘑菇體外的信息。

Rubin表示,事實上,這些突觸是在年輕和成熟的蒼蠅中看到的,這意味著這種聯繫是學習和記憶環節的重要組成部分。

他說:「當我們在幼蟲身上看到它們的時候,我們不確定它是否只是一個發育的神器,就像嬰兒的牙齒的神經元一樣。Janelia的FlyEM團隊證實了神經元在成人中的存在,研究合作者,Yoshi Aso,Toshi Hige和Glenn Turner發現突觸促成了蘑菇體的功能。

現在,這些隊伍正在繼續繪製著蒼蠅和幼蟲的神經系統。FlyEM正在利用軟體方面的進步,應用與Google合作的最新機器視覺和人工智慧方法,以及在Janelia內部開發的計算機演算法和軟體,使用10倍以上的神經元來繪製。管理FlyEM團隊的史蒂夫廣場(Steve Plaza)推測,如果不是簡化工作的計算能力,那麼完成這項研究的期限可能從18個月延長到10年。

魯賓表示對這個領域的進展感到非常興奮,「如果你一年前問我需要花費多少時間來繪製整個飛行大腦,那麼我會說:『三十年後我能夠看到它就已經很幸運了』,現在,我想說五年,這個領域真的要起飛了。」

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