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Oncotarget:對白血病研究常用細胞系進行測序 提高結果重複性

Oncotarget:對白血病研究常用細胞系進行測序 提高結果重複性



2017年2月24日訊 /生物谷BIOON/ --「突變是生命的一部分。基因中的突變就像文本信息中的排印錯誤,但究竟哪些突變會引發癌症?這是個問題。如果沒有好的模型系統對突變進行檢測就無法解決這一難題。」Watanabe-Smith博士這樣說道。

「我們對病人的DNA進行測序不僅要看已經知道的突變是否存在,還要尋找基因中的其他未知突變。而我們每次都會得到不同的突變結果。當我們在幾例病人中發現相同突變後,我們就知道這個突變值得進一步研究。」Cristina Tognon博士這樣表示。


這項研究的重點在於介紹該實驗室的模型系統,確保其他研究人員在尋找致癌突變的研究中能夠使用準確且可重複的實驗方法。


該研究對一個常用的細胞系進行了分析,檢測哪些突變對白血病和其他癌症的發生有重要作用。他們在研究中發現這個細胞系存在一個之前未報道過的缺陷,這個叫做Ba/F3的細胞系會獲得額外突變。


Watanabe-Smith指出:「潛在的影響就是無功能突變會變成有功能,如果是這樣的情況那麼可能得到的結果就不具有重複性。隨後我們提出一個問題:細胞癌變的發生是因為從父母那裡獲得的一個突變還是因為從別處獲得的新突變?」

最終研究人員建議在用Ba/F3進行實驗的過程中額外添加一步(對使用的細胞系進行測序)來提高結果的可重複性。雖然這些結果還需要得到更多研究證實,但是需要向科學界傳遞的信息已經很明確:在這個標準實驗中存在一些之前沒有預料到的潛在問題。


「我們利用這種方法加深我們對癌症的理解。我現在對於哪些因素促進了白血病的發生以及哪些藥物可以有效控制癌症有了更好的想法。」 Watanabe-Smith這樣說道。


相關研究結果發表在國際學術期刊Oncotarget上。(生物谷Bioon.com)


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原始出處:

Kevin Watanabe-Smith,et al.Analysis of acquired mutations in transgenes arising in Ba/F3 transformation assays: findings and recommendations.Oncotarget, 2017.

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