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變形菌門Proteobacteria


變形菌門Proteobacteria



變形菌門細菌形狀極為多樣,其成員均為革蘭氏陰性菌,外膜主要由脂多糖組成。變形菌門代表了細菌域中最大的一門,其中包括很多病原菌,如大腸桿菌、沙門氏菌、霍亂弧菌、幽門螺桿菌等。變形菌門物種和遺傳多樣性極為豐富,根據核糖體RNA序列,傳統上被分為5個綱,用希臘字母α、β、γ、δ和ε命名,最近又確立了一個新的ζ綱。

關鍵詞:變形菌 , 脂多糖 , 革蘭氏陰性菌


變形菌門(Proteobacteria)主要是由核糖體RNA序列定義的,名稱取自希臘神話中能夠變形的神Proteus(這同時也是變形菌門中變形桿菌屬的名字),因為該門細菌具有極為多樣的形狀。該門成員均為革蘭氏陰性菌,其外膜主要由脂多糖組成。變形菌門代表了細菌域中最大的一門,其中包括很多病原菌,如大腸桿菌、沙門氏菌、霍亂弧菌、幽門螺桿菌等。


變形菌門物種和遺傳多樣性極為豐富,這決定了該類群涵蓋了極為廣泛的生理代謝類型。比如,該門中既有好氧菌也存在厭氧菌,既有自養型也有異養型,既存在光能型也存在化能型。因此,變形菌門內的物種在農業、工業、醫藥、衛生、環保等領域具有重要應用價值,廣泛用於氮肥促進利用、植物病蟲害防治、工農業廢水處理、土壤修復和複雜污染物降解等。


變形菌門根據核糖體RNA(rRNA)序列,傳統上被分為五類(通常作為五個綱),用希臘字母α、β、γ、δ和ε命名,最近又確立了一個新的ζ綱。

1α-變形菌綱


α-變形菌除包括光合的種類外,還有代謝C1化合物的種類、和植物共生的細菌(如根瘤菌屬)、與動物共生的細菌和一類危險的致病菌立克次體目。此外真核生物的線粒體的前身也很可能屬於這一類。


2β-變形菌綱


β-變形菌包括很多好氧或兼性細菌,通常其降解能力可變,但也有一些無機化能種類(如可以氧化氨的亞硝化單胞菌屬(Nitrosomonas))和光合種類(紅環菌屬(Rhodocyclus)和紅長命菌屬(Rubrivivax))。很多種類可以在環境樣品中發現,如廢水或土壤中。該綱的致病菌有奈氏球菌目(Neisseriales)的中一些細菌(可導致淋病和腦膜炎)和伯克氏菌屬(Burkholderia)。在海洋中很少能發現β-變形菌。


3γ-變形菌綱

γ-變形菌包括一些醫學上和科學研究中很重要的類群,如腸桿菌科(Enterobacteraceae)、弧菌科(Vibrionaceae)和假單胞菌科(Pseudomonadaceae)。很多重要的病原菌屬於這個綱,如沙門氏菌屬(Salmonella)(腸炎和傷寒)、耶爾森氏菌屬(Yersinia)(鼠疫)、弧菌屬(Vibrio)(霍亂)、銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)等。重要的模式生物大腸桿菌也屬於此綱。


4δ-變形菌綱


δ-變形菌包括基本好氧的形成子實體的黏細菌和嚴格厭氧的一些種類,如硫酸鹽還原菌(脫硫弧菌屬(Desulfovibrio)、脫硫菌屬(Desulfobacter)、脫硫球菌屬(Desulfococcus)、脫硫線菌屬(Desulfonema)等)和硫還原菌(如除硫單胞菌屬(Desulfuromonas)),以及具有其它生理特徵的厭氧細菌,如還原三價鐵的地桿菌屬(Geobacter)和共生的暗桿菌屬(Pelobacter)和互營菌屬(Syntrophus)。


5ε-變形菌綱


ε-變形菌只有少數幾個屬,多數是彎曲或螺旋形的細菌,如沃林氏菌屬(Wolinella)、螺桿菌屬(Helicobacter)和彎麴菌屬(Campylobacter)。它們都生活在動物或人的消化道中,為共生菌(沃林氏菌在牛中)或致病菌(螺桿菌在胃中或彎麴菌在十二指腸中)。

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