R語言學習-入門環境Rstudio

R語言是比較常用的統計分析和繪圖語言，擁有強大的統計庫、繪圖庫和生信分析的Bioconductor庫，是學習生物信息分析的必備語言之一。

Rstudio是編輯、運行R語言的最為理想的工具之一，支持純R腳本、Rmarkdown (腳本文檔混排)、Bookdown (腳本文檔混排成書)、Shiny (互動式網路應用)等。

Rstudio版本

Rsdutio分為桌面版和伺服器版，桌面版可以在單機使用，伺服器版可以從瀏覽器訪問供多人使用。

伺服器版安裝好之後，訪問地址為，用戶名和密碼為Linux用戶的用戶名和密碼。

Rstudio安裝R安裝

Linux下安裝

Rstudio安裝前需要安裝R，如果使用的是新版的操作系統。直接可以用 或者來安裝。

若系統版本老，或沒有根用戶許可權，則需要下載編譯源碼安裝，最新地址為https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.4.0.tar.gz。

具體編譯方式為 (Linux下軟體安裝見 http://blog.genesino.com/2016/06/bash1):

Windows下安裝

下載https://cran.r-project.org/bin/windows/雙擊就可以了。

Rstudio安裝

Linux下安裝伺服器版

安裝參考 https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/

安裝完之後的檢測、啟動和配置

Rstudio日誌目錄，方便查看錯誤信息：/var/log/rstudio-server/

配置文件：

Timeout

/etc/rstudio/rserver.conf

/etc/rstudio/rsession.conf

Windows下安裝桌面版

下載之後 (https://www.rstudio.com/products/rstudio/download2/)雙擊安裝，需要使用管理員許可權，其它無需要注意的。

Rstudio 使用

Windows下桌面版直接雙擊打開即可使用，Linux伺服器版訪問地址為，用戶名和密碼為Linux用戶的用戶名和密碼。

Rstudio 界面

Rstudio中新建或打開文件

如果是桌面版，直接就可以訪問」我的電腦」去打開之前寫過的腳本。如果是伺服器版，可直接訪問伺服器上寫過的腳本。Rstudio右下1/4部分可以切換目錄，點擊more，設置工作目錄。可以上傳本地的腳本到對應目錄打開。

Rstudio還有其它的功能，不過這些對我們初學使用已經足夠了。後續會根據需要推出基於ggplot2作圖的R入門介紹。

Reference

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