外泌體研究資料庫大揭秘
外泌體(exosomes)是一類由細胞分泌的胞外囊泡結構,由於其內部包含有DNA,蛋白,脂類,RNA等信息,可以作為細胞間交流的載體而受廣泛關注。那麼,現在有哪些外泌體資料庫可用呢?今天,小編和大家分享三個外泌體相關資料庫。
1. ExoCarta(http://exocarta.org/)
ExoCarta是一個收錄了包括人(Homo sapiens),大鼠(Rattus norveqicus),小鼠(Mus musculus),綿羊(Ovis aries),豚鼠(Cavia porcellus),果蠅(Drosophila melanogaster),馬(Equus caballus),穴兔(Oryctolagus cuniculus),牛(Bos taurus)在內的幾個物種的286個研究結果,涉及到不同組織器官來源的外泌體中的蛋白,mRNA,miRNA,脂類等信息。同時,該資料庫把在不同研究中多次鑒定到,可能作為marker的100個蛋白進行了統計。該資料庫為開放平台,個人研究發現結果,該資料庫也歡迎大家上傳更新。該資料庫最新更新時間為2016年09月12日。
Vesiclepedia是一個專門收錄胞外囊泡研究的資料庫,涉及到的物種有33個,來源研究538個,包含了包括凋亡體,微泡,外泌體等在內的囊泡中發現的蛋白,mRNA,miRNA 和脂類信息。資料庫最新更新時間為2015年1月1日。
3. EVpedia(http://student4.postech.ac.kr/evpedia2_xe/xe/)
EVpedia是一個收錄了原核和真核生物胞外囊泡研究的資料庫。該資料庫將不同囊泡研究(包括外泌體)中發現的蛋白,mRNA,miRNA,脂類,代謝產物進行了整理。當然,該資料庫對可用於囊泡marker(蛋白,mRNA,miRNA等)進行了歸整。除此之外,該資料庫還可以進行數據分析和功能注釋。該資料庫最新更新時間為2015年2月6日。
以上三個資料庫有專門收錄外泌體,也有收錄囊泡研究的。雖然從數量上來說,不是非常多,但是,從涵蓋的內容來說,基本滿足了外泌體研究的基本需求。應該來說,這些資料庫無論是對做人,大小鼠模式動物的,還是做其他生物外泌體研究的小夥伴們,都可用來參考。
休閑娛樂時間
甲:你知道一個女人對公司完全失望以後的樣子么?
乙:不知道。
甲:我老婆上班都不化妝了,她說這樣的公司不配讓她浪費化妝品。
來源:新聞早報。
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