平成兩大奧特曼相遇，他們的答案是什麼

戴拿奧特曼遭到權衡參謀的暗算之後失去力量，雖然最後權衡參謀以做自己的生命為代價給戴拿奧特曼補充了能量，將斯菲亞打敗。但是由於耗能過多，戴拿奧特曼的人間體飛鳥在火星上暈倒。之後被迪迦奧特曼的人間體大古所救，大古和他的妻子一直隱居在火星培養火星植物

飛鳥問迪迦奧特曼的人間體戰鬥的意義是什麼，大古告訴他要自己去尋找答案。大古的答案就是人類最終要靠自己的力量去戰鬥，之後良來到大古這裡把飛鳥接走。最終BOSS的索菲亞黑洞終於出現了，這些有行星規模大小的球形生命體形成了巨大化的連體形狀，索菲亞行星本體隱藏於由時空能量組成的旋渦中心

旋渦中心是擁有著足以吞噬一切星球力量的黑洞，三秒鐘便可毀滅一顆星球，若是被吸進去了，即便是光也別想出來，不出一周的時間，整個太陽系就會它毀滅。為了阻止TPC的新麥格斯炮發射計劃，派出超合成獸新蓋加雷德前來木星，它並不是戴拿奧特曼的對手，但是抓住良做人質

超合成獸新蓋加雷德站在黑洞的前面手裡抓住良的戰機，阻擋超級勝利隊的新麥格斯炮，狩矢隊員一直猶豫不決，隊長為了全人類下令讓他開炮，但是依然無法下手最後副隊長幸田代替狩矢的位置，就在他要開炮的時候戴拿奧特曼突然闖入，將良救出。副隊長幸田趁機開炮將怪獸打死，但是黑洞並沒有徹底消失

回到基地後眾人商議怎麼消滅黑洞的時候，飛鳥提出黑洞受到攻擊的時候會有那麼一瞬間出現縫隙，對著這個縫隙攻擊的話就可以打敗它。但是有人提出讓飛鳥拿出證據來，這種關鍵時刻不能靠推測，在飛鳥一直猶豫的時候，喜比隊長告訴大家其實飛鳥就是戴拿奧特曼。

眾人知道飛鳥就是戴拿奧特曼的時候商定了作戰方案，此時索菲亞球體的影子貫穿紐約、倫敦、巴黎、東京、莫斯科等各重要城市，威脅人類屈服，叫囂著宇宙將被黑暗所征服，但是雖然這個球體看著很大，只不過是假的幻影沒有質量，用來嚇唬普通的人類

最終SUPER GUTS與戴拿奧特曼一起相互合作，在新麥格斯炮的策應下，戴拿用索爾捷特光線擊潰了索菲亞黑洞的本體，宇宙又重現光明.可是,戴拿奧特曼因為爆炸後的衝擊波來不及逃脫引力，被吸進了扭曲的黑洞，穿越到了其他的次元。