生信工作諮詢速遞-怎麼又是single cell？

single cell, single cell, single all the day...又到了一周一更的生信工作諮詢速遞環節了，距離上次更新已經過了12天了， 要是今天再不更新的話，我估計會被BOSS拖出去K.O.了。

處於強烈的責(kong)任(ju）感，於是就非常自（bu)覺(qing)地(yuan)去翻了翻我的任務列表，決定繼續推送一期和單細胞測序相關的工作好了。

這次推送的工作來自於EMBL-EBI，劍橋醫學研究中心和劍橋大學生物科學學院三者合作提供的十一個聯合博士後研究員的其中一個。

主要研究者（Principal Investigators）

這項工作有兩名PI，第一位是來自於劍橋幹細胞研究所（Cambridge Stem Cell Institute）的David Kent, 他的研究方向是正常和惡性幹細胞的單細胞命運決定，近期發表的工作（2013~2016）都屬於單細胞測序。

猜猜誰是PI

第二名PI是Moritz Gerstung，來自於歐洲生物信息學研究所（EMBL-EBI），研究方向是癌症發育的潛在機制並據此找到資料方案。我去他的主頁上翻了翻，基本上是一年3篇文章的節奏，多的時候可以能發6篇，而且大部分都是ELife, Nature Communication, Nature Genetics, Science級別的文章。

研究背景

人體的造血幹細胞（HSC）自我再生和分化處於一個非常巧妙的平衡狀態。如果造血幹細胞分化過少，那麼就無法提供足夠的成熟的血細胞，如果造血幹細胞分化過多，幹細胞群體被消耗枯竭，無異於殺雞取卵。

隨著單細胞測序技術的發展，逐漸發現了HSC中重要的異質性，讓我們重新審視單細胞是如何進行命運決定，還找到了四種不同的HSC類型（在自我更新周期，數目和細胞類型上存在差異）。

由於HSC分離後的功能純度(functional purities)大於50%， 單細胞測序（scRNA-Seq）和單細胞移植結果(single cell transplantation outcomes)就可以非常有效的結合起來，用於更加細緻地剖析每個HSC細胞和它們的分化後代。

但是，這裡有一個但是，如此大的數據量也使得分析具有挑戰性，讓機制模型和單細胞功能之間的聯繫存在障礙。

我也看不懂，放在這裡湊個數

要求

我們的任務是：

訓練一種分類器處理單個HSC移植後代

基於體內流式細胞儀在移植後多個時間點採集的數據，分析並建立單個HSC再生動力學模型

綜合白血病前和白血病突變模式小鼠的數據，更好的理解白血病是如何從單個細胞演變的

從這些要求來看，這次工作對數據分析的能力要求很高，真的需要一名訓練有素的博士後，不是一般人能hold住的。

如何申請

說一件非常尷尬的事情，由於我的拖延症，2017年的申請（7月1日截止）已經成功被錯過了，但是沒有關係呀，你可以做一點準備呀，明年還可以繼續申請呢。

此外，如果你覺得單細胞測序實在是難度太大了，你可以考慮一下生信工作資訊速遞-喜大普奔，終於被我找到國內公司了, 據Jimmy說他們公司還沒有找到合適的人才，再來一波簡歷唄。然後我翻了翻那篇文章的閱讀記錄，不知不覺快2200了，要是再多300，不敢想下去。

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