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一個tasiRNA位點響應葉鏽病侵染

一個tasiRNA位點響應葉鏽病侵染

昨天Planta上發表了一篇題為「Identification and molecular characterization of a trans-acting small interfering RNA producing locus regulating leaf rust responsive gene expression in wheat (Triticum aestivum L.)」的文章。

隨著研究的深入,microRNA以外的small RNA會研究的越來越多,今天簡單介紹下這篇文章。研究過miRNA的同學,可能知道一個叫TAS3的位點,這個位點產生的小RNA就是tasiRNA。tasiRNA,英文全稱是「Trans-acting-small interfering RNA」,大概就是順式作用的小干擾RNA,而且是植物特有的一類小RNA。tasiRNA像miRNA似得也有靶基因。一個明顯的特徵是tasiRNA的產生需要miRNA的介導,也可以說miRNA切割tasiRNA的前體序列。

下圖(b)是ta-siRNA的產生過程,注意需要miR-173參與。

再看下面的示意圖,箭頭所示是miR173的切割位點,而後邊3個21nt的RNA可以被稱作tasiRNA,這些tasiRNA也有自己的靶基因,作用方式和miRNA作用靶基因的方式差不多。

理解了什麼是tasiRNA,我們提到的這篇文章理解起來就比較簡單了。

大概就是,發現了一個新的能產生tasiRNA的位點,並且這個位點產生的四個tasiRNA響應葉鏽病侵染,這個位點與28S rRNA有一定的相似性。這四個tasiRNA的靶基因都與脅迫響應有關。隨便看了下,這個位點在我搞的small RNA庫里的表達情況,發現表達非常高,而且降解組文庫也有相當的表達分度,看來是tasiRNA無疑了。下圖顯示的表達情況。

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