最大的侵略，奧特曼和防衛隊幾乎全軍覆沒
高斯奧特曼的最大對手的就是混沌病毒，混沌病毒還曾複製過高斯奧特曼的力量，雖然第一出現的時候被打敗，但是並沒有真正的消失，地球上迎來了久違的和平，但是這只是暴風雨前的寧靜，在武藏他們享受和平的生活的時候，混沌病毒再次出現，這次也已經影響到了地核
混沌病毒在全世界引發地震，並把所有沉睡的怪獸喚醒。在全世界的地下開始有了怪獸活動，不僅如此混沌病毒奧特曼再次出現，目的是為了襲擊土阱隊員和羽角博士。因為他們在研製對抗混沌病毒的終極武器，而且有了眉目。青年精英隊全體出動，由於混沌病毒奧特曼實力強大
青年精英隊出師不利，人人挂彩。就在他們傷的傷殘的殘的時候，武藏變身成高斯奧特曼，高斯奧特曼一出場就是日冕形態，接著變身成日蝕形態，此時的高斯奧特曼實力還在混沌病毒之上，但是就在高斯奧特曼要贏的時候，混沌病毒奧特曼的力量被加強。變成強化型混沌病毒奧特曼
高斯奧特曼本來就不是他的對手，能量又快耗盡，幾乎處處挨打。最終被打回人間體，而土阱等人因為研製成功了第一階段提前撤離。被混沌病毒奧特曼打壞的只是空的研究所，眾人將武藏救回後發現，武藏的身體幾乎被掏空，整個忍虛脫，甚至隨時都有死的可能
當混沌病毒奧特曼發現研究沒有被打斷的時候再次來襲，不過青年精英隊本來就全體帶傷所以很難阻止他的前進，再次彈盡葯絕，在武藏前去參戰的時候，綾乃似乎要對武藏表白，但是還沒有說出口。武藏和高斯奧特曼都抱著破釜沉舟的心態去參戰，哪怕戰鬥到最後一刻
可惜的是高斯奧特曼依然不是他的對手，在被打到半死的時候土阱的研究成果終於了突破性的進展，雖然只是雛形但是已經可以使用。風吹隊員用土阱研製的彈藥射向混沌病毒奧特曼，對方表現的很痛苦。高斯奧特曼趁機配合青年精英隊的攻勢將其打敗
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