PNAS：Trio全外顯子測序發現早發性高度近視候選致病基因

摘要：高度近視的遺傳病因幾十年來一直不清楚。早發性高度近視（EOHM）定義為在6歲以下的時候屈光度低於或等於-6屈光度，這個年齡段的兒童不太可能接受高教育壓力，我們研究了早發性高度近視（EOHM）的遺傳因素。使用trio（兩個非患病父母和一個患病孩子）全外顯子測序分析致病突變。我們在16個先證者中鑒定了遺傳自父母的複合雜合突變或未知功能的新生突變。有趣的是，在EOHM患者中確定的新發突變的概率明顯增加。在新鑒定的候選基因中，在一個EOHM先證者中鑒定出BSG新發突變。在1,040名患者擴大篩選，在BSG基因上發現另外四個突變。然後，我們構建了Bsg突變小鼠，以進一步闡明該基因的功能影響，並觀察到典型的近視表型，包括延長的軸向長度。在EOHM中使用基於一家三口trio外顯子研究，我們解釋了沒有近視父母的EOHM患者的新發突變的突出作用。疾病基因BSG的發現為近視發展及其病因提供了新的見解，這擴大了我們目前對高度近視的認識，可能對未來的治療和預防有所幫助。

PMID：28373534

遊俠點評：本文的科研思路是對16個trio家系進行全外顯子分析，通過隱性遺傳模式分析發現了6個已知的致病基因，通過新發突變發現了17個候選致病基因，但是因為樣本量少沒有重疊的新發突變基因，接下來用14種生信軟體分析這些位點的危害性，發現BSG基因的危害性比較高，並且BSG的功能與高度近視比較相關，然後在1000多例散發病例中只驗證這個BSG基因，又發現了四個可疑的致病位點（悲催的是沒有父母樣本，不知道是不是新發突變，哪怕只有一個證明是新發突變也是很強的證據），沒有辦法，只能構建敲除小鼠看看基因表達與表型情況，結果還是很不錯的，最後生信分析一下這個基因與之前已知致病基因有沒有蛋白左右作用。如有哪位朋友有類似課題，歡迎找遊俠合作，分析靠譜價格優惠！

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