通過挖掘 DNA 數據,這家基因公司希望找到治療帕金森病的方法
摘要:23andMe 聯合製藥公司和美國老齡化研究所,共同發布了有史以來規模最大的帕金森病研究分析報告,他們在基因數據中發現了和帕金森相關的十幾個位點。
23andMe 是美國的一家基因技術公司,其名稱來源於人的 23 對染色體,他們曾推出基於唾液的個人基因組檢測,被《時代》雜誌評為 2008 年的年度發明。這個服務目前的售價是 99 美元,只要按說明將自己的唾液寄送給 23andMe,就可以得到一份個人基因檢測報告。
9 月 12 日,23andMe 宣布獲得由紅杉資本領投的 2.5 億美元巨額融資,目前估值達到了 17.5 億美元。雖然個人基因組檢測還是其主要業務,但 23andMe 終於開始了新的基因研究嘗試,基於 DNA 數據挖掘來研究下一代的重要藥物。
與製藥公司合作,尋找帕金森病的治療方法
在 2015 年,23andMe 與 Genentech 和 Pfizer 等製藥巨頭達成合作協議,共享客戶的基因數據,同時開始從 200 多萬用戶中挖掘 DNA 樣本。23andMe 表示,有超過 85% 的人願意將自己的基因數據貢獻出來用於科學研究,這也使他們擁有了世界上最大的基因研究資料庫。據稱,Genentech 需要支付 6000 萬美元來獲得這些數據。
23andMe 計劃將基因數據用於更多的疾病醫療研究,他們認為這會給一些疾病的治療帶來巨大幫助。本周,23andMe 宣布了這項研究的最新成果,他們在基因數據中發現了和帕金森相關的十幾個位點。
帕金森病是一種無法治癒的神經退化疾病,全球約有 700 萬帕金森病患者,美國佔了約 100 萬人。帕金森病的平均發病年齡約為 60 歲,年齡是預測帕金森病進程最好的指標。傳統上認為帕金森病不是遺傳性疾病,但經過證實發現,至少有 5% 的帕金森病是由一些特定的基因突變造成,23andMe 向自己的客戶展示了其中兩種。Google 創始人 Sergey Brin(23andMe 創始人 Anne Wojcicki 的前夫)就攜帶 LRRK2 突變。
但是科學家們不知道這種疾病的發病過程,甚至無法得知遺傳因素在基因突變過程中發揮多少作用。因為與 Huntington 舞蹈病和血友病不同,帕金森病沒有單獨的遺傳信息。23andMe 認為,通過暴力匹配可以測試出引起病變的遺傳因子,並找到新的治療方法。
史上最全的帕金森病研究報告
在 9 月 11 日,23andMe 聯合 Genentech 和美國老齡化研究所,共同發布了有史以來規模最大的帕金森病研究分析報告,包含 42.5 萬人的數據,其中 75% 以上為 23andMe 客戶。基於從 2014 年開始的一項研究,他們對 6476 名帕金森病患者和 30 多萬無疾病的 23andMe 客戶的基因進行比對,證實了帕金森病相關的遺傳變異,並發現了 17 項新的基因突變。
23andMe 遺傳學統計小組的首席科學家 David Hinds 是該報告的作者之一,在八年前他們只有幾千人的信息,當時他的團隊認為這已經足夠用來識別帕金森病基因,但很快便認識到問題比想像的複雜。David Hinds 提到:「當你對疾病的發病過程不了解時,需要有更大的樣本才能得出可靠的結果。」
藥物基因組學分析師 Derek Lowe 在一篇博客中提到,這份報告顯示了未來的可能性,但很難再更進一步。這項研究的樣本數據已經足夠大,但全基因組關聯分析在標靶藥物(只針對某一些特殊組織、細胞起作用的藥物)方面有局限性,特別是在帕金森病的領域。因為全基因組關聯分析更適合研究直接引起疾病的基因突變中,那些共有的特徵,而在帕金森病中的這些信息很弱。
這也是為什麼 Genentech 需要 23andMe 客戶中 3000 個帕金森患者的基因組。這些自願參與研究的患者詳細介紹了他們的家族病史,病情的進展,曾經嘗試過的治療方法和具體效果。通過對比 30 億個鹼基對,製藥公司希望能夠找到引發帕金森病的共有特徵,從而總結出疾病的遺傳性。另一方面,他們也在尋找那些有明顯特徵的基因突變,它們對疾病的影響更大,而且容易跟蹤識別。
在所有參與者的基因組都排列完畢之後,Genentech 會享有這些基因組數據的獨家訪問權兩年,然後這些數據會開放給整個學界使用。Genentech 的高級科學家 Rob Graham 表示,因為其遺傳因子的複雜性,帕金森病在個性化醫學上比癌症更具挑戰性。神經保護是目前帕金森病相關研究中最尖端的題材之一,以α-突觸核蛋白作為標靶的治療現在已進入臨床試驗中。
標靶藥物不同於藥物製造,至少對 23andMe 來說,這已經可以作為一項商業計劃。
文章參考:WIRED(http://t.cn/RpYlbnu)
本文由極客公園原創
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