細胞治療工藝中的質量源於設計

最新 09-21

將活體細胞作為治療藥物進行移植的治療方法為許多急性病和慢性病提供了新型的治療選擇。然而細胞的生物複雜性卻限制了細胞治療從實驗室規模放大到可靠、經濟的生產規模。我們在這裡提出一種應對以上挑戰的解決方法——通過質量源於設計(QbD)的原則來設計細胞的生產工藝。QbD將科學知識與風險評估整合到了生產工藝開發中，並已被生物製藥工廠所接受。雖然仍需進一步的技術開發才能完全實現，但在細胞治療生產工藝中存在著大量可以與QbD聯合的機會。而通過QbD鏈接可測分子，細胞群細胞特性與最終產品質量是實現細胞治療醫療轉變的關鍵步驟。

過去十年使用細胞作為治療藥物的細胞治療領域得到了空前的增長。雖然第一個造血幹細胞移植可以追溯到19世紀50年代，但對於不同適應症的細胞療法卻是隨著臨床細胞的培養技術突破而從近期才開始的。生產臨床應用的細胞治療產品通常需要以下步驟：獲取或生成起始細胞株；培養；改造；收穫；濃縮；純化；製劑，最終罐裝（以特定濃度和成分條件製備細胞治療產品, 分裝到最弱產品的「容器」中，以及其它分裝後過程）；儲存；以及產品運輸。雖然這些步驟與從哺乳細胞中生產治療蛋白的過程是相似的，但因為活體細胞的高度複雜性，對其作用機制的不完全了解，產品性質的不同以及初始材料的多樣性使得細胞治療產品的生產更為挑戰。而以上這些嚴峻的挑戰都可以利用QbD來進行解決，而在新的技術方案的放大實現中，產品的研發和生命周期的管理都是監管機構所推崇的。

2002年，美國FDA引進了cGMP倡議來應對藥物生產失敗追尋其潛在原因時的低效及挑戰，並在2006年國際協調會議上概述了QbD的框架，用系統的方法基於科學知識與風險評估來進行工藝和產品管理。今天，隨著小分子製藥生產對QbD的廣泛接受，越來越多的生物製藥生產也開始將QbD原則貫徹到它們的工藝中。雖然一些監管機構，如Health Canada, 目前只接受了針對於典型化葯和生物葯的以QbD為基礎的建議書，而在細胞為基礎的治療方法中使用QbD可以極大的提高對工藝和產品的理解和產出。事實上，細胞治療產品的生物複雜性使QbD的迭代原則尤為貼近於這種治療方式。

這裡我們回顧了主要的QbD概念（BOX 1）並討論其在四個臨床在研細胞治療產品中的應用：多功能幹細胞誘導的心肌細胞，造血干、祖細胞(HSPCs)，間質幹細胞(MSCs)和嵌合抗原受體(CAR)-T細胞(表1)。

這四種細胞治療產品吸引了眾多醫藥公司爭相投資。在新興的PSC誘導的治療方法中，Ocata Theerapeutics (美國)公司針對致盲症的PSC誘導視網膜細胞療法已經進入臨床實驗，目前已經被Astellas Pharma(東京)公司以3.79億美元收購，Novartis(瑞士)公司投資了3500萬美元給Gamida Cell(以色列)公司的臍帶血擴增技術，並達成與Regenerex(美國)公司在HSPC產品上的獨家許可與合作事宜。2010年Mesoblast(紐約)公司與Cephalon(現在是Teva公司的子公司，以色列)達成了一項20億美金的MSC技術合作項目。針對惡性疾病的CAR-T細胞療法是Novaritis與賓州大學(費城)；Pfizer公司(紐約)與Cellectis公司(巴黎)；Amgen公司(美國)與Kite公司(美國）;GlaxoSmithKline公司（倫敦）與Adaptimmune公司(英國);Celgene公司(美國)與Bluebird公司(美國);Celgene公司與Juno Therapeutics(西雅圖)合作與收購的主題。然而即使這些或其它的細胞療法已經有了令人興奮的臨床進展，但生產中仍有許多挑戰需要克服。QbD提供了一個合理的框架來應對這些挑戰並促進細胞療法作為一種常規治療選擇的實現。如果這些挑戰不被解決將導致全行業都無法實現在可控成本條件下生產出高質量的產品，也會影響全球範圍內>600個再生醫學臨床實驗的產業化。

應用QbD進行細胞生產

生物反應器系統因其可規模化，易於集成檢測技術及可以自動響應來維持環境均一性等特點，成為生產治療型蛋白所需的細胞培養方法。然而，這些系統是為了獲得高蛋白產量而設計的，而不會優先考慮細胞本身。相比之下,細胞治療產品生產過程中生產出的健康的功能細胞對環境因素有高度的敏感性。許多生物反應器類型，細胞生產模式，規模和控制參數目前已經可以應用於細胞治療產品生產中(圖1)。了解這些不同的「模塊」的性能和它們如何應用於細胞治療產品生產對於QbD是至關重要的，相反也可以應用QbD更深入了解以上要點。

QbD包括產品和工藝描述，表徵，設計，監控和持續改進(圖2)。而這些都由對基本生物學和某一產品及其工藝工程的深入了解來指導。

QbD由目標產品質量概況(目標產品的質量指標; QTPP)，直接影響產品安全性和有效性的定義屬性(關鍵質量屬性)，通過定義這些會影響性能的參數(關鍵過程參數)和建立設計空間來限制影響質量屬性的參數變異。接下來，開發控制策略來保持過程參數在一個範圍內來確保產品質量，並且在放大過程中進行工藝驗證。相對於傳統的基於離散點的控制策略，QbD標識了一個可以生產出高質量產品的可以接受的操作區域或多元設計空間。一旦實施，這個生產工藝被監控且隨著對工藝的深入理解可以被不斷改進(圖3)。

目標產品質量概況(QTPP)

QTPP描述了所需終產品的屬性，如一致性，效力和純度，這也是QbD的起點。我們展示了四個細胞治療產品的QTPP作為舉例(圖2)。重要的是，每個細胞治療產品的一致性，效力和純度的定義取決於各自使用的療法。定義嚴格，標準容易衡量是建立QTPP的關鍵。

鑒定對於蛋白和小分子藥物，鑒定由分子組成來定義。然而，細胞鑒定(即，表型)是複雜的連續體，通常知之甚少。鑒定通常可以通過細胞表面某種功能活性相關的標誌蛋白存在與否來證明，鑒定使用流式細胞術。然而，這種方法可能會遺漏其它由生產工藝或工藝改變引起的表達變化的信息標誌。對細胞效力穩定快速的生物分析可以緩解這些擔心，但也需要更多的關註標准化鑒定分析。在體內鑒定與血液重構相關的細胞表面標誌性質廣泛應用到了對造血系統研究中的鑒定上。在一些情況下，多種細胞類型的存在有助於臨床，這被反應在鑒定屬性上。在2006年，MSC的最小鑒定標準被首次提出，這些細胞主要作為多功能細胞代替治療被開發出來。如今，熱點在於免疫分子聯合含有不同性質MSC的更廣泛組織來源，而這需要新的鑒定標準來確定治療相關的分群。在CAR-T工藝中，目標細胞群必須表達嵌合抗原受體（CAR）和正確的T細胞標記。可以用於鑒定產品及區分未轉換T細胞和不良的已轉入CAR的細胞，隨著越來越多特異性CAR被開發出來，開發出可以鑒定非需、與細胞治療產品共反應的可靠檢測將成為必需。

效力細胞治療產品不僅要有正確的同一性，他們的功能也必須與體外的功能分析中表現的一致。檢驗這些功能的關鍵因素是效力，它能測量藥物活性，是評價工藝過程變化所帶來的影響的重要手段。測試分泌細胞因子的生物活性將是一種更合適的效價測定方法。在前面的例子，CAR-T細胞破壞靶細胞作為細胞工程的結果，其作用機制能被更好地理解。CAR-T細胞與表達適當的靶抗原細胞在一起孵育可以用來量化T細胞脫顆粒，細胞因子的釋放，以及其在體外的增殖和細胞毒性。CAR-T細胞由於具有同一性，單一的檢測不能充分定性其多種方式的效力。

效力與力量不同，有劑量依賴性。兩種藥效等效的藥物中，較低強度藥物是首選藥物。同樣，從風險和成本的角度來看，在低強度或可行的細胞密度下，具有高效力的細胞治療產品是首選。很多方法可用於確定細胞密度和存活力，各有優缺點。製造商應該仔細考慮哪種方法對產品最合適，並確保所獲得的數據反映了預期用途。例如，細胞密度和活力往往是通過測量中間代謝活動來間接測量，可以被其他因素影響，包括改變種群構成，線粒體的含量或活性，底物充足、生長介質的氧化還原狀態或溫度。

純度細胞治療產品的雜質可以包括不合需要的細胞類型，污染，輔助材料和微粒。細胞純度的閾值在治療之間有所不同。心肌細胞治療，移植心肌細胞瞬時節點誘發心律失常，而非心臟細胞與心臟組織沒有電磁耦合，也可能導致心律失常。在PSC來源的細胞治療，僅有1/4000剩餘的未分化 PSCs也會導致畸胎瘤。雖然這個閾值低於流式細胞儀檢測水平–基於表型分析，最近描述的方法例如對心肌細胞的代謝選擇或者抗PSCs的篩選可以大大降低這種風險。，在雙臍帶造血干祖細胞移植中，T細胞雜質可以引起免疫併發症，雖然T細胞和其他細胞在移植中也有輔助功能。骨髓間充質幹細胞是已知的多功能細胞，而在CAR-T細胞療法，增生性幼稚或中央記憶T細胞在最後CTP（細胞治療產品）中的比例可能影響療效。對於基因工程改造獲得的細胞治療產品，純度分析必須確定所需的改進型細胞的頻率，其他類型的細胞，和任何的遺傳工程帶來的脫靶效應。

細胞培養對各種污染很敏感，顯著的微生物（細菌、真菌、支原體）、內毒素和細胞交叉污染，使他們不適合使用。此外，由製造設備和材料所產生的非細胞的顆粒物（包括塑料碎片，殘留的載體和纖維）必須被嚴格控制。CTPS的生產一般需要生物活性物質的雞尾酒，包括細胞因子、小分子、血清和載體。這些輔助材料必須充分除去，以免被視為藥物本身。他們也可以改變其他過程生物可變因素。例如，二甲基亞碸，常用的冷凍保護劑，可以增加增塑劑從生物反應器管道中浸出，和pH值指標可以影響細胞的分化。因此，質量目標產品配置文件必須描述這些輔助材料在最終產品中的最大殘留水平以確保其安全性，而且需要有額外的處理以免影響最終的細胞產量。

關鍵質量屬性和關鍵工藝參數

在開發製造工藝流程時，確定能保證產品質量的決定性屬性是必須的。這些關鍵質量屬性可以是物理的，化學的，生物學的，或微生物特性或特徵，且應在適當的限度，範圍，或分布以保證預期的產品質量。換句話說，關鍵質量屬性是QTPP屬性，直接關係到產品的安全性和有效性，包括那些在表2中列出的屬性。

關鍵質量屬性受關鍵工藝參數和原材料屬性變化的影響，必須加以控制。關鍵工藝參數包括細胞功能特徵如生長動力學、細胞年齡、細胞分泌的因子或特異基因的表達，而非細胞特徵，如原材料屬性、物理化學參數（pH、溶解氧、溫度）或外源因子的濃度。闡明相關的關鍵質量屬性、關鍵工藝參數和原料屬性，包括進行實驗、機制建模、使用先驗知識和應用廣泛的分析技術。

一旦確定了這些參數和屬性，就進行風險評估，按重要性對最有影響的關鍵工藝參數和材料屬性進行研究（圖2）。關鍵質量屬性直接決定產品的質量，而關鍵的工藝參數和材料屬性的影響關鍵質量屬性間接影響產品質量。一些關鍵質量屬性可能與可識別的關鍵工藝參數和材料屬性無關（圖3）。

關鍵質量屬性指導工藝過程和產品開發，並應隨著工藝過程知識的發展而不斷改良。早期的工藝發展過程中，一個基礎廣泛的多參數細胞屬性的分析對於確定在以後的開發階段集中在一組更為明確的的關鍵參數是有用的。值得注意的是，識別和測量關鍵質量屬性的取值是具有挑戰性的。若不首先對關鍵質量屬性有所理解，複雜的多參數研究（「設計空間」下面討論）可能價值有限，這些研究確定多種參數對關鍵質量屬性的影響。因此，早期CTP的發展應著眼於確定關鍵質量屬性，隨著這些基礎知識的增長，日益成熟的經驗或機制實驗模型可以用來探索的關鍵工藝參數和材料特性的影響。

產品的安全性和有效性受許多過程參數的影響，包括生物反應器系統的操作特性。例如，攪拌不僅可以確保均勻的環境條件也改變剪切敏感的細胞表型。溶氧影響PSCs，HSPCs和間充質幹細胞，對效力和純度有潛在影響。即使輕微的pH值變化也會產生重大影響，如果不加以控制，細胞代謝會降低pH值。代謝副產物也會直接影響結果。例如，乳酸的積累和pH值的降低與細胞生長受抑制和PSC 表型損失有關。媒介交換率和策略（例如，批，分批或灌注）可以用來控制廢物和內源分泌因子積累。

CTP生產中使用的反應物不斷改進。許多候選的CTPs，來源於複雜的血清基質培養在成纖維細胞上，越來越傾向於通過化學限制性培養基來培養，無異物，cGMP配方，以減少工藝的可變性。然而，起始試劑的可變性（基礎培養基、重組蛋白、小分子和起始細胞來源）仍然存在，必須加以量化。減少培養基的組分的策略將減少所需cGMP等級數，減少大量需驗證的試劑。生長因子和小分子在小批量臨床開發中往往不易獲得，而且價格昂貴，生長因子活性變化很大，可能對過程結果產生重大影響。基於標準化和一致的細胞活性檢測，或最好是結構敏感的生化檢測，以減輕相關風險。

細胞擴大通常是一個經濟考慮，但如果它影響CTP質量，可能是一個重要的質量屬性.對於病人具有特定性的CTPs，細胞擴大實現的程度可能影響劑量。生產HSPC和CAR-T療法來源於單一供體的細胞需要足夠的細胞擴張以達到靶劑量。相比之下，異源的 CTPs，需要重點考慮細胞老化和穩定性。延長的細胞擴大和酶分離現象也會導致基因異常的累積。細胞數量的從而影響效力（削弱的分化潛能）和純度（增加的變異細胞）。

細胞信號因子的分泌可能是一個效能屬性或一個關鍵的過程參數。在PSC系統中，自分泌和旁分泌信號是需要的，以維持多功能表型。類似地，向心肌細胞分化的過程中，循環灌注料可以緩解骨形態發生蛋白（BMP）的激動劑和拮抗劑累積所帶來的心室樣細胞純度降低。培養HSPC也會有這種情況，分泌型細胞因子的積累是 CTPs質量的主要決定因素，因此也是一個關鍵的過程參數。相比之下，MSCs通過免疫調節因子的分泌獲得療效，從而代表一個關鍵質量屬性。持續發展的可測量分泌因子的在線感測器系統將提高我們對細胞培養中分泌因子的理解和控制能力。細胞擴大過程取決於起始細胞數量和所用試劑的質量。HSPC擴張產量變化與起始細胞群的表型（CD34 +的分數）非線性相關。篩選系統已發展到可以量化觀察PSC分化潛能的可變性；由於捐贈者個體的差異CAR-T細胞治療在細胞輸入量和所輸入細胞得組分方面，具有高度的可變性。這些療法的效力與細胞增殖的相關性最好，療效可能通過選擇特異性細胞亞型而受掌控。在病人特異性的細胞治療療法中，捐贈者的差異與同種異源療法一樣，可以通過QbD方法加以系統研究從而控制或減輕這種變異的來源。

產品設計空間

設計空間描述關鍵工藝參數和關鍵質量屬性材料的交互作用和變化範圍，或「正常操作範圍」，這與保持產品質量是相容的。關鍵工藝參數的可變性與CTP生產特別相關，因為輸入細胞的可變性和關鍵工藝參數之間的複雜相互作用，必須相應地加以調整。設計空間內的更改不被視為工藝變更，因為它們對關鍵質量屬性的影響已經被研究並確定是可以接受的。QbD 的這一特徵極大地減少了管理機構的負擔。FDA的觀點是，在可靠的科學數據和健全的質量體系基礎上改變設計空間內的操作參數不需要發布通告。此外，定義良好且經過驗證的設計空間不需要進行大量的內部測試，因為系統的性能已經得到了描述（只剩下發布測試作為主要測試步驟）。

設計空間是在多因素過程、實驗和系統建模的基礎上發展起來的。我們舉例說明了一個關鍵工藝參數和一個材質屬性的設計空間（圖2）。雖然在一個複雜的CTP系統中建立一個高度自信的設計空間是具有挑戰性的，有兩個互補的工具可以用來指導設計空間開發：實驗設計（DOE）和系統建模。

實驗設計

DOE描述了一組方法，對於有組織和有結構的科學研究，以理清因素和結果之間的關係。生物反應器的控制下，使得對細胞在響應一系列關鍵工藝參數的變化後的行為做出系統評價成為可能，從而識別最優操作條件和闡明產品工藝的設計空間。已有的方法可以在統計學上有意義的探索和多參數過程的界定方法涉及到一系列的測試來確定輸入變數（單獨或組合）對結果的影響。DOE可以用來開發由傳統方法逐步優化看起來高不可攀高度的過程，從而增加過程的健強性和成本效率，此外它還可以用來進行綜合成本分析。多參數研究將受益於使用新的小規模生物反應器系統來開發關鍵工藝參數的響應面（方框2）。

基於DOE的相互作用的兩個關鍵工藝參數的影響的調查（播種密度、攪拌速率）對PSC培養確定了工藝優化，逐步實驗可能會錯過。關於播種密度的相似研究，培養基體積和補料時間使用響應面分析法以確定細胞分裂之後細胞最佳產量的條件。在對HSPC 的研究中，我們早期研究細胞擴大所必需的細胞因子，多個研究採用了DOE方法的探索和優化細胞培養。從造血幹細胞產生中性粒細胞，有研究發現此過程受四種細胞因子的交互作用所控制，這一過程如果沒有DOE方法不可能被發現，使用細胞因子的簡化模型也不可能發現。在對MSC的研究中，初步設計空間已經確定了不同的微載體，細胞接種密度，葉輪幾何參數對最終細胞擴大的影響。

DOE必須將關鍵過程參數不僅與細胞擴大相關的關鍵質量屬性聯繫起來，而且還要與身份、效力和純度屬性相關聯。我們強調的是多參數的調查應該只針對最重要的關鍵質量屬性；過度分析風險識別無關的特性，可能導致對生產過程中的狀態信息的誤導。隨著過程知識的發展，對關鍵質量屬性和關鍵過程參數的反覆評估有助於消除不相關參數的研究。

系統建模

鑒於細胞與環境之間相互作用的複雜性，系統建模將使得開發設計空間獲益巨大。大組學數據集提供了構建減少參數的機制模型的出發點，這一模型將關鍵工藝參數與關鍵質量屬性聯繫起來（圖3）。儘管迄今為止還沒有產生過這樣的模型，但各種各樣的模型技術已被用於整合細胞和生物信號，以預測與CTP生產相關的關鍵質量屬性。幹細胞過渡狀態的劃分模型指導微環境調控和培養補料策略。基於組學數據的代謝途徑分析和重建已被廣泛應用於優化生物製藥生產並適用於CTP生產。這些分析，描述了特定氨基酸對於PSC 培養的關鍵性，而代謝通量分析已被用於描述在不同的氧水平PSCs 指數生長時代謝通路的活性，以預知培養基的配方。最近，PSCs 來源的心肌細胞不同的乳酸代謝模型已被利用來實現高純度的心肌細胞，表明基於代謝建模來優化CTP生產是可行的。

隨著產品的發展，大量的有價值的數據積累起來。將這些數據關聯到關鍵質量屬性，以建立起網路模型達到預測目的技術得以開發。例如，統計工具如多元分析可以識別基因的子集（或其他元素）在組學數據，這些數據與所期待反應有關。這種方法確定了多種樣品中的起始和最終的HSPC的種群構成，這一種群構成是一個關鍵的工藝參數，可被用於作為其他病人特定治療的起始材料變異性種群構成的參考。基於擴展模型以識別關鍵過程參數，基於基因表達數據集，模型設計空間的發展，需要與確定關鍵工藝參數相關的基因調控網路的預測和驗證。最近關於輸入因子與變化的細胞狀態的相關性計算表明，基因調控網路可以鏈接關鍵工藝參數和關鍵質量屬性。CTP領域的有價值的下一步是使用建模技術將表型與效力聯繫起來。

控制策略

過程分析技術是一種設計、測量、監測和控制關鍵過程參數（包括pH值、溶氧、溫度、密度和營養水平）的方法，是QbD的一個重要元素。生物製藥的生產工藝使用先進的控制策略實現對工藝變數的在線監測和控制，這些技術同樣適用於CTP生產。的確，CTPS與其他生物製劑相比而言增加的複雜性，為更先進的監測和控制策略的創造了一個很好的機會。最近，我們的團隊展示了在人類臍帶血擴大工藝中，實時監控和控制可溶性信號因子，以增加細胞的產出。分泌因子的測量和控制，細胞群組成和其他先進的工藝參數，這些因素的重要性在細胞療法中越來越被認可。

QbD的未來應用

儘管CTPs生產的產業化面臨諸多挑戰，其前景十分樂觀。幾十年細胞培養產業化工藝設計的經驗，提供了在生物反應器的放大和強化，細胞代謝，培養基設計，補料策略優化和工藝過程式控制制方面的工業化基礎。我們對細胞與環境相互作用的理解認識正在提高，能夠控制細胞環境的生物反應器系統，正在生成越來越集中於分子和細胞信息的數據集。與此同時，我們對細胞狀態的分子基礎的認識，包括粘附依賴，代謝網路狀態，集落形成和增殖的控制，正在不斷提高。雖然我們在此集中討論的是上游生產工藝過程，QbD對下游操作同樣適用。同樣，工藝設計只是產品生命周期的一部分，利用這裡描述的QbD工具為CTP生命周期創造了靈活可變又經得起檢驗的工藝。

CTPs的未來取決於細胞生產低成本技術的發展。鑒於CTPs固有的複雜性和它的生產工藝，將今天試驗中CTPs轉換成廣泛使用的藥物，QbD方法是必不可少的。

參考文獻：

Lipsitz YY, Timmins NE, Zandstra PW.Quality cell therapy manufacturing by design.Nat Biotechnol. 2016 Apr;34(4):393-400.

識別微信二維碼，添加生物製品圈小編，符合要求即可有機會進入生物製品圈微信交流群！

註明：姓名+研究方向！

版

權

聲

明

喜歡這篇文章嗎？立刻分享出去讓更多人知道吧！