生信從業4年的一些感悟

現在依舊記得2013年的那個「十一」假期，在所里安裝ubuntu的情境，無助焦慮，吃飯的時候都感覺如鯁在喉。如果我告訴你，在此之前我沒有接觸過谷歌，沒有安裝過系統，你一定會詫異。

但事實就是如此，我之前在農場養過雞，做過林木調查，做過銷售，甚至曾想去做物流，可是從來沒想過會做生物信息這一行。原因很簡單，我讀大學乃至讀研究生的基本訴求就是找個不錯（工資高）的工作，至於自己適合做什麼，喜歡幹什麼，一直也沒想明白。摸爬滾打，不斷給自己挖坑，然後硬著頭皮往前沖，不經意間已經吃生信這碗飯2年，倒騰生信4年，目前仍舊是在生信這條路上蹦次蹦次的二貨。

為什麼做生信？

話說回來，選擇做生信這一行應屬機緣巧合，剛好我厭倦了在所里每天重複用氣相色譜測氣的日子（覺得沒有前途），剛好實驗室有一批測序數據需要處理，老闆又有足夠的耐心讓我去倒騰這批數據（其實沒找到更合適的人），然後就慢慢走上了生信這條不歸路（其實真的是越做越喜歡）。

為什麼寫博客？

一個零基礎的小白自學生信的過程是很痛苦的，關於我那個課題生物信息方面的中文資料又太少。剛開始我買了一本perl語言入門，發現書看一遍就忘了。後來才意識到純粹的看書是沒有任何價值的（因為缺乏知識框架），需要帶著問題看書，比如說，我需要統計每個基因序列區段的測序深度，就需要知道怎麼讀取數據，如何拆分行，怎麼循環，怎麼加減，如何寫數據，然後將這些任務拆分，一個個的去解決，這樣就有了我的第一個腳本，雖然花了半天寫出來的代碼很醜，但它的確是可以工作噠。我發現，在每天不停地接觸新東西的過程中，一個月前解決的問題或理解的東西，後面再用的時候，有些已經忘了。在搜集資料的過程，也看到了一些比較有趣的博客，比如「有個博客」，「博耘生物」等，然後突發奇想，我是不是也可以倒騰一個博客。於是就開始寫「每日一生信」這個博客，將每天學習的過程，分析過程，所遇到的問題以及一些思考記錄下來。後來覺得在新浪上發博文，會出現各種廣告以及莫名其妙的敏感辭彙，所以乾脆就弄了自己的第二個博客「sam』s note」。(點擊閱讀原文直達作者博客)

關於職業的認知

我很喜歡健明倒騰的論壇的名字「生物技能樹」，生信工程師更像是膠水，連接著生物學家與軟體工程師。需要會寫網頁，能查資料庫，會敲代碼，能玩操作系統，能用程序做圖，了解統計，有生物背景，關鍵還要會修電腦。而我們在這個行業的成長過程，就是不斷去完善這些技能。從最開始模仿別人的程序和腳本，到自己寫腳本完成某個任務，再到寫演算法優化自己的流程，最後到運用大數據解決某個問題。

當然僅有這些技能是遠遠不夠的，最終還是要回歸到具備快速解決問題的能力。我們畢竟不是程序猿，更多的是要學會「拿來主義」，在解決一個問題之前，一定要先去搜索資料，看別人是否做過，是否可以直接拿來解決我們的問題。如果僅抱著解決一個問題，要掌握各種知識細節的話，就會陷入一直在學習，卻無法超越學習的怪圈中。所以，一定要弄清楚眼前的問題，快速解決它，很多細節以及底層的理論基礎後面可以慢慢再去消化和理解（有些細節後面可能根本碰不上）。

從最開始對這個行業的懵懂，硬著頭皮往前沖，到現在越陷越深，主要是我願意花時間去倒騰。雖然至今依舊菜鳥一枚，但是我很享受每次看到新技術的興奮以及解決某個問題帶來的成就感。」enjoy it」也許就是從事生信最好的一個狀態。

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