菌群作用很複雜，神秘面紗始揭開

今天是第523期日報。

SI：飲食、菌群與腫瘤的複雜關聯（綜述）

SEMINARS IN IMMUNOLOGY

[IF:9.611]

通過小鼠腸道腫瘤模型建立菌群與癌症的關聯，提示細菌多樣性及群落變化在腫瘤中的因果作用； 細菌可能作為癌症治療的個性化藥物，益生菌和糞菌移植的安全性有待驗證； 益生菌在癌症治療的十字路口上，可成為藥廠的又一主要收入來源，也可作為輔助療法； 飲食在調節菌群中起重要作用，全球化通過對經濟、文化、教育、農業、氣候的影響重塑了全世界的飲食組成； 研究特定飲食對菌群組成及功能的影響，對以菌群為靶點的腫瘤治療十分關鍵。

The intricate connection between diet, microbiota, and cancer: A jigsaw puzzle

2017-09-01 DOI: 10.1016/j.smim.2017.08.009

FI：菌群與免疫系統的複雜互作

Frontiers in Immunology

[IF:6.429]

概述植物及動物擁有的不同類型的免疫系統，以及菌群如何受到不同免疫系統的調控，並與免疫系統互作； 分析宿主早期暴露對菌群耐受性及免疫系統的發育與功能的重要性，以及菌群在宿主間進行傳播對宿主-菌群的潛在共同進化、及宿主-菌群互作的長期穩定性的重要性； 比較在短命植物、小鼠模型系統、人類及昆蟲中的現有證據，強調研究菌群，識別菌群與宿主免疫相互作用，理解菌群對宿主健康的作用。

The complex interplay between microbiota and host immunity across systems

2017-09-14 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01114

IJMS：一文讀懂β-葡聚糖（綜述）

International Journal of Molecular Sciences

[IF:3.226]

β-葡聚糖是一種具有生物活性的纖維或天然來源的多糖，具有抗腫瘤、抗炎、抗過敏、免疫調節等多種生物活性； 作為天然來源的活性物質，可內服，可作為食品添加劑或日常飲食的一部分，且安全無毒； 體外、動物以及人體實驗均證實β-葡聚糖具有抗腫瘤、免疫調節、骨再生、抗糖尿病/肥胖、降血脂/血壓、抗基因毒性/誘變/氧化等效應； 綜述了常見β-葡聚糖的結構、來源及功能，並比較了在體外及動物體內實驗中β-葡聚糖的生物活性。

Clinical and Physiological Perspectives of β-Glucans: The Past, Present, and Future

CIMB：宏基因組數據可視化分析方法（綜述）

CURRENT ISSUES IN MOLECULAR BIOLOGY

[IF:5.250]

宏基因組為交叉性研究領域，包括分子遺傳學、微生物生態學和數據分析； 宏基因組數據可視化技術分為三部分，單個宏基因組、數個宏基因組、多宏基因組的視覺顯示； 單個宏基因組資料庫的可視化分析包括提取某些特徵，餅圖、圓圈圖、柱狀圖、重疊等； 數個宏基因組資料庫的可視化，每個樣本不同分類等級上的分類丰度，包括餅圖、柱狀圖、Phinch、箱線圖、統計分類樹、熱圖； 多宏基因組則包括氣泡圖、Sankey圖表和樹狀圖。

Methods for The Metagenomic Data Visualization and Analysis

2017-07-06 DOI: 10.21775/cimb.024.037

FM：乾酪乳桿菌BL23分泌的微泡與其益生效應相關

Frontiers in Microbiology

[IF:4.076]

從益生菌乾酪乳桿菌BL23中分離膜微泡（MV），其大小在30-50nm量級，與革蘭氏陽性菌的MV類似； MV攜帶的胞質組分包括DNA、RNA及蛋白質，利用蛋白組學方法鑒定出MV中的103種蛋白，其中有13種僅在MV中存在； MV中的蛋白包括：細胞被膜相關及分泌蛋白、熱/冷休克蛋白、某些代謝酶、蛋白酶、核糖體的結構組分、膜轉運體、細胞壁相關水解酶、噬菌體相關蛋白； p40、p75及LCABL_31160產物（一種黏著蛋白）介導了乾酪乳桿菌BL23的益生效應。

Lactobacillus casei BL23 produces microvesicles carrying proteins associated with its probiotic effect

2017-09-20 DOI: 10.3389/fmicb.2017.01783

FI：女性糖尿病，與尿液菌群失調與尿液IL-8相關

Frontiers in Immunology

[IF:6.429]

收集70名女性2型糖尿病（T2DM）患者（無尿路感染）和70名匹配的健康對照（HC）的尿液樣本； 70名T2DM患者中，46例其尿液中可檢測到IL-8（WIL8），24例檢測不到（NIL8）； WIL8及NIL8組的尿液菌群組成相似，但惰性乳桿菌在WIL8組中顯著增多； 「≥HC」組（特定細菌屬不少於HC組）有17個屬增加，16個屬降低； 18個細菌屬促進了T2DM患者尿中的IL-8，並解釋了尿液菌群總變異的95.6%。

Dysbiosis of the urinary microbiota associated with urine levels of proinflammatory chemokine interleukin-8 in female type 2

2017-08-25 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01032

AJRCCM：ICU中肺炎患者的多重耐藥性病原體感染風險

American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine

[IF:13.204]

分析316例臨床和微生物學診斷的ICU獲得性肺炎患者，其中99例HAP，217例VAP； 最常見的病原體為銅綠假單孢菌、金黃色葡萄球菌、革蘭氏陰性腸桿菌，MDR病原體導致107例患者發生肺炎； 204例VAP和85例HAP患者具有1條以上MDR危險因素，最常見的危險因素包括住院≥5天，90天前靜脈使用抗生素； 目前的MDR肺炎的危險因素敏感性高，特異性低； 經驗性抗生素的使用對2016年指南的依從性為19%-40%，83%的患者和61%的MDR病原體得到了充分治療。

Evaluation of the 2016 Infectious Diseases Society of America/American Thoracic Society Guideline Criteria for Risk of Multi-drug Resistant Pathogens in Hospital-acquired and Ventilator-associated Pneumonia Patients in the Intensive Care Unit

2017-09-13 DOI: 10.1164/rccm.201708-1717LE

SR：細支氣管炎嬰兒的口咽菌群如何變化

Scientific Reports

[IF:4.259]

嬰幼兒細支氣管炎會導致口咽菌群失衡，選擇27例住院細支氣管炎的嬰兒與22名同齡的健康嬰兒，在治療前和臨床康復後進行取樣，發現患者糞便和OP微生物多樣性均低於健康兒童； 健康和患病嬰兒的口咽菌群都以鏈球菌屬為主，患病嬰兒的糞便菌群含有積累的擬桿菌屬和鏈球菌屬，與健康嬰兒顯著不同； 治療後，患者的糞便菌群和口咽菌群與治療前相當； 失調的口咽菌群可能增加病原體侵入的易感性。

Dynamic oropharyngeal and faecal microbiota during treatment in infants hospitalized for bronchiolitis compared with age-matched healthy subjects

感謝本期日報的創作者：花開，桃李不言，葯農，沈志勛，女巫，小扣啊

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