這種星系是大小、形狀或構造與眾不同的星系，還有衛星星系

特殊星系是大小、形狀或構造與眾不同的星系。特殊星系通常是由兩個星系之間的交互作用造成的，也許比典型的星系有更多的塵埃與氣體，或是有較低的表面亮度，也或者有其他的特性，例如相對論性噴流。它們的形狀由於和其他的星系遭遇，在巨大的引力下而呈現出高度的不規則性。

這一類星系的特殊性質主要是因星系核的活動和主星系同伴星系之間的相互擾動造成的。特殊星系可分為類星體、塞佛特星系、N型星系、射電星系、馬卡良星系、緻密星系、蠍虎座BL型天體、有多重核的星系和有環的星系等等。這些星系的命名，有的是根據歷史情況，有的是根據星系特性，有的是根據發現者的名字而來的。已知上述各類星系之間有重疊、交錯的情況。例如，馬卡良星系中至少有10%可歸入塞佛特星系，N型星系中有很多又屬於射電星系。

有的特殊星系外圍有伴星系(常形成擾動形態)，有的有外環，有的旋臂殘缺。在射電圖上，在一些射電星系外區，可以觀測到相距很遠的射電雙子源或射電包層。絕大多數特殊星系都有核心區爆發遺留下來的痕迹:或是從中心向兩個相反方向射出光學噴射物;或是向四面八方發散纖維狀的稀薄氣體;或是星系中心分裂;或是出現塵埃暗條。此外，有的還有不規則的電離氫區分布。

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