高大上的研究怎能少了此等神器？

都說機制研究難難難，而國自然基金如果不深挖一下機制，中標的機率可謂微乎其微。分子機制N多種，適合自己的才是最好的~轉錄調控、ceRNA機制、甲基化之類或許講得有點濫了，今天就給大家介紹個泛素化修飾~

蛋白質泛素化是一種常見的翻譯後修飾，泛素是一類低分子量的蛋白質分子，在一系列特殊的酶（泛素激活酶E1、結合酶E2和泛素連接酶E3）作用下，能夠與特定的靶蛋白分子結合，對其進行泛素化修飾，而泛素化修飾往往會使靶蛋白降解，從而起到調控蛋白質表達的作用。

今年的國自然已經放榜，從上榜情況來看，泛素化調節依舊是一個不錯的方向，有深度有寬度，有逼格有品味，甚得評審的心意！

看到這麼多中標的，吃瓜群眾是不是也忍不住想要擼起衣袖大幹一場了？想要研究泛素化，你首先得確定泛素酶和底物雙方是誰，這就涉及到靶蛋白的識別，泛素化修飾中，靶蛋白的識別一般是通過E2或E3識別靶蛋白的特定Lys殘基而將泛素連接到靶蛋白上。但是泛素酶千千萬，到底是哪個才是我所研究靶基因的另一半呢？

我們既可以從底物出發（靶蛋白）搜索潛在的E3，也可以從E3出發搜索它所能結合的底物。

比如我們檢索一下TP53相關的E3，我們可以根據預測結果的可信程度進行篩選（Cofidence score），也可以根據E3的家族分類進行篩選。從下圖中我們看出FBXO11與TP53的關係最為密切，然後依次是MIB2、MIB1。

點擊網路圖中的泛素名稱還是查看具體的泛素化位點和E3的識別域，基金評審看到這樣的圖就知道你不是在異想天開，痴人說夢了~

此外，選擇evidence mode可以查看具體的evidence類型：

雖說是預測工具，但是還是會有很多文獻報道過的，這裡我們也可以查看到底有多少文獻報道過底物-E3之間的相互作用，文獻報道的多自然可信度就高了，但相應的創新性可能會有所下降。

當然了，利用資料庫分析預測，只是泛素化調節研究的第一步，後續如何嵌套其它機制研究，以及如何設計實驗，大家可以從小張的課程中了解更多~

關注後獲取《科研修鍊手冊》1、2、3、4、5，基金篇、生信特輯

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