蛋白質組學檢測糖蛋白質組的合成及降解

今天與大家分享一篇發表在Analytical Chemistry上的文章「Simultaneous quantitation of glycoprotein degradation and synthesis rates by integrating isotope labelling, chemical enrichment and multiplexed proteomics」。文章的通訊作者是喬治亞理工學院的Ronghu Wu教授，他們課題組主要通過蛋白質組學技術研究蛋白翻譯後修飾以及細胞代謝。

蛋白糖基化在細胞功能中有著重要作用。糖基化修飾不僅調控蛋白活性而且可能通過空間位阻而保護糖蛋白免於蛋白酶降解。很多重要蛋白都可以被糖基化修飾，而它們的動態平衡將對細胞功能產生重要影響。本文作者通過集合pulse-SILAC結合化學富集技術，可以同時監控糖蛋白的降解及合成。具體來說就是先構建重標SILAC細胞系，在細胞基本長滿後，切換到輕標培養基繼續培養，然後通過基於硼酸的化學富集方法、多重標記（TMT）以及生物質譜技術進行蛋白質組學分析。這樣，通過不同時間點的比較，就可以通過重標肽段的減少得知糖蛋白降解速率，而通過輕標肽段的增加得知糖蛋白合成速率。

本文巧妙的結合了pulse-SILAC以及多重標記的化學蛋白質組學技術，在組學層面實現糖蛋白組的合成及降解同時檢測的效果。編者按，如果可以進一步引入糖修飾速率的檢測可能更有利於闡述糖基化修飾對於蛋白質穩態的作用。

http://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.7b02241

原文引用：

DOI: 10.1021/acs.analchem.7b02241 (2017).

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