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利用基因「條形碼」量化珊瑚礁生態系統中的關鍵種群

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在珊瑚礁系統中,幾乎所有不同種類的、色彩豐富的珊瑚魚都起源於小而無色的蝌蚪狀幼蟲,即使是專家也無法用肉眼識別區分它們的種類—這已成為研究珊瑚礁生態學的巨大挑戰。

目前,魏茨曼科學研究所(Weizmann Institute of Science,WIS)的RotemSorek教授、特拉維夫大學(TelAviv University)動物學院和斯坦哈特自然歷史博物館(TheSteinhardt Museum of Natural History)的RoiHolzman教授以及本·古里安大學(BenGurion University)的Moshe Kiflawi博士提出了一種準確區分珊瑚礁周圍水體中的幼蟲種類的方法。他們的研究樣本囊括了位於Eilat和Aqaba之間的海灣中幾乎所有珊瑚魚類的基因「條形碼」,研究結果不僅能顯示出海灣中存在哪些幼蟲,還能獲得遊動幼蟲的數量、年齡以及棲息深度。該研究已於12月18日在線發表在《自然生態與進化》(Nature Ecology and Evolution)雜誌上。

Holzman教授介紹:「了解幼蟲的種類和分布十分重要,因為只有幼蟲才會被水流沖刷,而成年的珊瑚魚往往只在珊瑚礁附近遊動。對於海洋生態學家來說,幼蟲是生態系統中不可或缺的一部分,也是未來生態系統的組成部分。另外,由於幼蟲的數量可以揭示成年魚的潛在種群,監測幼蟲對於漁業管理來說也是很有幫助的。」

研究人員首先在海灣兩岸附近的不同地點、深度,以及深海中部取樣,每月兩次,共收集了一萬多個幼蟲樣本;之後在Sorek教授的實驗室里,通過基因組測序技術識別幼蟲種類。Sorek教授說:「在識別幼蟲種類之前,必須建立一個包含海灣中所有珊瑚魚類基因組的資料庫,最終我們的資料庫中收錄了頻繁出現在珊瑚礁中的約80%(~540種)主要魚類物種的基因條形碼。」據悉,基因「條形碼」技術是一種基於特定基因的DNA技術,其序列因物種而異,並在生物學研究領域中廣泛應用。

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