請時刻保持清醒：沒有絕對的「好」菌和「壞」菌

今天是第633期日報。

Cell子刊：沒有絕對的「好」與「壞」，微生物也不例外

Cell Host and Microbe

[IF:14.946]

① 「好」細菌有「壞」的一面：梭菌屬IV及XIVa群可誘導IL-10及Treg以抑制結腸炎，但可能也抑制了宿主的抗腫瘤功能；② Akk菌可能具有修復上皮黏膜、緩解炎症等益生作用，但在帕金森症、多發性硬化等患者中的丰度升高；③ 「壞」細菌也有「好」的一面：一些大腸桿菌菌株似乎有益，幽門螺旋桿菌則似乎與兒童過敏疾病風險降低相關；④ 微生態療法要特別注意平衡好與壞、利與弊的問題，比如糞菌移植（FMT）在治療一些疾病之外，可能會有潛在風險。

Good Bug, Bad Bug: Breaking through Microbial Stereotypes

2018-01-10 DOI: 10.1016/j.chom.2017.12.008

BMC B：十大問答，弄清宿主-微生物亦友亦敵的共生（必讀）

BMC Biology

[IF:6.779]

① 宿主與共生微生物間的關係，對宿主而言通常是有益且重要的；② 宿主生物表型不僅受遺傳影響，還受與共生微生物群落的關係的影響；③ 不同生物因共生而增強了相對生存適應性，這種共生關係在進化選擇下被強化，然而共生關係未必對其中每一方都有益，要視其生態情況而定；④ 雖然對很多核心因素仍所知甚少，但對簡單共生關係的進化生態學的研究已取得較大進展，這為研究複雜的共生微生物群落的組成和動態、及其對宿主表型的影響，打下了基礎。

Q&A: Friends (but sometimes foes) within: the complex evolutionary ecology of symbioses between host and microbes

Diabetologia：幽門螺旋桿菌陽性的中國人，糖尿病風險較低

Diabetologia

[IF:6.080]

① 招募45-74歲的中國非糖尿病成年人，跟蹤隨訪10年（1992-2002），檢測糖尿病發病及幽門螺旋桿菌（HP）感染狀況；② 2002年時，在2085名無糖尿病的受試者中，1208名（57.9%）為HP血清陽性，經多變數校正後，HP血清陽性與較低的糖尿病風險顯著相關；③ 2002-2007年間接受過HP檢測的受試者中，53.1%為持續性血清陽性，其相比HP持續性血清陰性的受試者的糖尿病風險也較低；④ HP感染與低糖尿病風險間顯著相關，背後機制有待進一步研究。

The association between Helicobacter pylori seropositivity and risk of new-onset diabetes: a prospective cohort study

NC：年齡及菌群均是淋巴常駐性T細胞的調節因素

Nature Communications

[IF:12.124]

① 非再循環T細胞可能存在於次級淋巴器官（SLO）中，但這些T細胞未被仔細研究；② CD4+調節性T細胞（Treg）及CD4+記憶性T細胞（Tmem）可在小鼠的SLO中長期存在；③ 僅有那些存在於派爾集合淋巴結中的T細胞被菌群影響；④ 淋巴結及非淋巴組織中的CD4 Treg及CD4 Tmem有著許多共同表型及功能特徵；⑤ 隨著年齡增長，存在於SLO中的T細胞逐漸增加，S1PR1下調可能促進了這種變化。

Profiling the lymphoid-resident T cell pool reveals modulation by age and microbiota

EP：塑料微粒引發斑馬魚腸道菌群失調和炎症

Environmental Pollution

[IF:5.099]

① 塑料微粒（MP）是海洋污染物，可具有水生動物毒性；② 為研究MP對魚類腸道菌群的影響，將斑馬魚暴露於兩種濃度（100和1000μg/L）兩種大小（直徑0.5和50μm）的聚苯乙烯MP環境中，持續14天後對其腸道菌群用定量實時PCR和16S測序進行分析；③ 高濃度MP使斑馬魚腸道黏液分泌增加，菌群中擬桿菌門和變形菌門丰度下降，厚壁菌門增加，29個菌屬發生顯著變化；④ IL1α、IL1β、IFN等腸道炎性因子分泌增加；⑤ MP可誘發斑馬魚腸道菌群失調和炎症。

Polystyrene microplastics induce microbiota dysbiosis and inflammation in the gut of adult zebrafish

2018-01-02 DOI: 10.1016/j.envpol.2017.12.088

FI：玉米纖維+鼠李糖乳桿菌，改善老年人腸道菌群及免疫系統

Frontiers in Immunology

[IF:6.429]

① 40名60-80歲的健康老年人隨機分成合生製劑組（鼠李糖乳桿菌GG或GG-PB12聯合可溶性玉米纖維SCF）、益生元組（SCF）和安慰劑組；② 3周後，鼠李糖乳桿菌GG聯合SCF可增加NK細胞活性，增加顫螺菌屬丰度，降低總膽固醇和低密度脂蛋白膽固醇濃度；③ 兩種益生菌聯合SCF均可顯著增加Parabacteroides菌丰度，降低脫硫弧菌丰度；④ 鼠李糖乳桿菌GG-PB12聯合SCF可顯著降低C反應蛋白濃度；⑤ 鼠李糖乳桿菌GG聯合SCF可改善老年人腸道菌群和免疫系統。

Effects of Soluble Corn Fiber alone or in Synbiotic Combination with Lactobacillus rhamnosus GG and the Pilus-Deficient Derivative GG-PB12 on Fecal Microbiota, Metabolism, and Markers of immune Function: a randomized, Double-Blind, Placebo-Controlled, Crossover Study in Healthy Elderly (Saimes Study)

2017-12-12 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01443

PLoS M：陰道菌群與性傳播疾病的關聯

PLoS Medicine

[IF:11.862]

① 陰道菌群失調包括厭氧性失調、致病共生菌增生等類型，與細菌性陰道炎、外陰道念珠菌感染、陰道無乳鏈球菌感染及性傳播感染病之間高度相關；② 性傳播是引起陰道菌群失調的疾病的重要因素，菌群失調引起陰道黏膜損傷，又增加了性傳播疾病的感染風險；③ 研究陰道菌互作機制有望為開發新藥物提供助力；④ 治療陰道菌群失調相關疾病，需要考慮長期用藥以破壞生物被膜，防止複發；⑤ 鑒定易感人群並選擇最優預防/治療方法，是新興的研究方向。

The vaginal microbiome and sexually transmitted infections are interlinked: Consequences for treatment and prevention

2017-12-01 DOI: 10.1371/journal.pmed.1002478

AEM：產後的陰道菌群，或許比已知的還要複雜

Applied and Environmental Microbiology

[IF:3.807]

① 分析來自馬拉維農村的1107名產後婦女的陰道菌群特徵；② 以陰道加德納菌為主的陰道菌群中缺乏常見的陰道乳酸桿菌（即使在產後一年後採樣），屬於群落狀態類型IV，可進一步分為4個亞群；③ 產後時間越長，惰性乳桿菌主導的陰道菌群越常見，但陰道加德納菌仍是優勢菌種；④ 產後高比例的厭氧消化鏈球菌與妊娠期較短和新生兒較小相關；⑤ 陰道菌群沒有恢復到乳酸桿菌佔主導的婦女再次懷孕情況未知，可能並不是所有缺乏乳酸桿菌的菌群都是不利的。

Lactobacillus-deficient vaginal microbiota dominate post-partum women in rural Malawi

2018-01-05 DOI: 10.1128/AEM.02150-17

感謝本期日報的創作者：沈志勛，瀟洒小姐，小胖子，this little piggy，小腸君，女巫

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