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10元轉錄組分析:這次真的是乾貨了 灰常干

乾貨

東北一類乾的價格不菲的食物總稱,既然大家期待已久,快過年了就給大家整兩斤嘗嘗~~~~~~

你需要準備的材料

首先得有,大家如果僅僅是聯繫的話先準備50元,其實不多也就是網咖里幾個小時的網費。準備一台配置內存4G起,最佳。然後去下載一個軟體叫做然後去註冊一個。

操作步驟

登陸https://cloud.tencent.com註冊一個賬號登陸這個賬號充個值20元。具體操作關注公眾號以後回復就可以獲得這樣你就有一台自己的伺服器了打開終端 輸入然後輸入你剛才登入的密碼然後去試一試如下命令cd ..lsmkdir xxx這些命令的使用以及linux基本操作什麼的問問度娘這些我都不會說的,哼這些過程下次會分步驟詳細教給大家。

劃重點了-到底怎麼省錢

第一:轉錄組mapping的軟體推薦用STAR,原因:天下武功無快不破。我們購買的是時間計費的雲伺服器所以快就是省錢。第二:騰訊雲的配置可以在後期更改,也就是說當你運算的時候再用那些高配置就可以啦!!!當你運算的時候再用那些高配置就可以啦!!!當你運算的時候再用那些高配置就可以啦!!!而當你的時候,完全可以用那個配置去傳輸當然帶寬需要調高可以了。當你需要高內存的時候,再調高配置這樣就可以了

來來來-金牛座帶你算賬了

經過實際測試,在你已經掌握linux基本操作的前提下,就是上面說的那幾條命令。每個樣本從上傳開始到最後Bam文件以及Counts定量文件下載到本地一共。詳細如下:一般PE150的數據壓縮以後最多8G,上傳的速度1M/s,所用時間為,低配置1元/小時,一共需要。用STAR mapping,高配置運行需要,高配置Htseq-count做定量高配置完成,,其實STAR有一個命令可以直接輸出counts數,這樣這步。當然有人會問index還費時間呢,這個當然在作mapping之前你需要有建立好的index文件,用STAR建立需要,這個成本會隨著你使用次數增加而稀釋,。然後做完一次項目雲伺服器點,關機的話還會計費的,我被坑過,後來聯繫客服才知道。關於index還可以這樣,你可以建立好index以後選擇製作鏡像,在同一地區購買的雲伺服器可以使用保存好的鏡像,就跟系統還原一樣每次重新建立的時候選擇自定義鏡像就好了。

來自於吐槽星的留言

「去年初這位因為被亞馬遜雲伺服器玩了一把,重創1萬元,還跪了搓衣板,看來還是有用的。可惜我沒有搓衣板可以跪啊」——隔壁師兄「等的我花兒都謝了,希望他快的寫完那幾個基金多多出教程」——隔壁師弟「我的天!!!還真是10元啊,又可以省錢買雞腿了」——隔壁二師弟「師兄好厲害,不愧是金牛座」——隔壁師妹「來來來獎金不要了是不是,你找企鵝去領工資吧」——主任

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