驚奇：糞菌移植用到豬身上了，效果和價值還賊大

今天是第639期日報。

FM：糞菌移植可改善新生仔豬的腸道健康

Frontiers in Microbiology

[IF:4.076]

杜洛克豬、長白豬、約克夏豬雜交的12頭仔豬隨機分為2組； 一組經口腔進行糞菌懸液接種，另一組口服相同體積的無菌生理鹽水，糞菌移植的供體為健康成年金華豬； 厚壁菌門、普雷沃氏菌科等在接受了糞菌移植的仔豬結腸中增加，變形菌門、梭桿菌科等減少； 糞菌移植組的仔豬平均日增重增加，腹瀉發生率降低，腸道形態及緊密連接屏障得到改善； 腸道黏膜中sIgA+細胞密度增加，杯狀細胞數量增加，MUC2、β-防禦素2、TLR2/4的表達增加。

Exogenous Fecal Microbiota Transplantation from Local Adult Pigs to Crossbred Newborn Piglets

2018-01-09 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02663

FM：LGG在仔豬中抑制沙門氏菌感染並抑制自噬

Frontiers in Microbiology

[IF:4.076]

斷奶仔豬在鼠李糖乳桿菌GG（LGG）處理後感染嬰兒沙門氏菌； 嬰兒沙門氏菌感染降低迴腸粘膜菌群多樣性，澱粉乳桿菌增加，類諾卡氏菌屬、副球菌屬等8種菌屬減少； 嬰兒沙門氏菌易位至肝臟，LGG減少其易位，其益生效應與變形菌門、厚壁菌門、擬桿菌門中的一些成員增加相關； 建立LGG與嬰兒沙門氏菌的共培養模型，LGG抑制嬰兒沙門氏菌對IPEC-J2的感染，降低細胞死亡率； LGG可抑制嬰兒沙門氏菌引起的細胞自噬，促進細胞的EGFR及Akt磷酸化。

Lactobacillus rhamnosus GG affects microbiota and suppresses autophagy in the intestines of pigs challenged with Salmonella Infantis

2018-01-17 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02705

BJN：日常飲食高纖維，對菊粉響應更明顯

British Journal of Nutrition

[IF:3.706]

34名健康志願者根據飲食調查分成低膳食纖維（LDF）組和高膳食纖維（HDF）組，組內分別給予菊粉型果聚糖益生元和安慰劑干預3周； 益生元可使顯著增加LDF和HDF組雙歧桿菌屬丰度； 此外，HDF組中Faecalibacterium菌屬丰度顯著增加，糞球菌、Dorea和瘤胃球菌屬丰度顯著降低； 相比LDF組，HDF組的腸道菌群反應更大，因此更有可能受益於菊粉型果聚糖益生元； 研究用該益生元調節腸道菌群促進健康時，應考慮習慣性膳食纖維攝入的情況。

Habitual dietary fibre intake influences gut microbiota response to an inulin-type fructan prebiotic: a randomised, double-blind, placebo-controlled, cross-over, human intervention study

FC：蓮子抗性澱粉的結構特徵和潛在益生元效應

Food Chemistry

[IF:4.529]

用乙醇沉澱法（濃度分別為20%和30%）分離蓮子抗性澱粉得到兩種組分，LRS3-20%和LRS3-30%，分子量為20~40和10~20kg/mol； 相比LRS3-30%，LRS3-20%的溶脹力和溶解度較小，但兩者水分和抗性澱粉含量無顯著性差異； LRS3-20%表面粗糙且明顯可見分層條狀和溝槽狀，LRS3-30%表面相對光滑； 二者為B型晶體結構，LRS3-20%含較多有序結構和雙螺旋體； LRS3-20%對雙歧桿菌和嗜酸乳桿菌表現出較高的益生元活性，或可在食品產業中作為益生元劑。

Structural properties and prebiotic activities of fractionated lotus seed resistant starches

2018-01-15 DOI: 10.1016/j.foodchem.2018.01.057

BMCPC：孕期吃益生菌，有益/負面影響或都不大

BMC Pregnancy and Childbirth

[IF:2.263]

對涉及27項研究的49篇文獻進行系統性綜述及薈萃分析，其中沒有研究涉及合生製劑，有一項研究涉及益生元，其餘全部是關於益生菌； 不定期服用益生菌並不會增加或者降低早產風險：其中5項涉及1017名孕婦的研究中，早產定義為

Pregnancy outcomes in women taking probiotics or prebiotics: a systematic review and meta-analysis

COM：蜜蜂可作為研究腸道菌群的模式生物（綜述）

Current Opinion in Microbiology

[IF:6.635]

蜜蜂有簡單的腸道菌群，易於實驗操作，可作為研究腸道菌群的模式生物； 菌群中的5個核心菌種包括位於迴腸的G. apicola和S. alvi、直腸中的L. Firm-5、L. Firm-4和B. asteroides，菌株多樣性高； 對限菌蜜蜂的研究揭示了不同菌種的功能及對蜜蜂健康的影響； 這些菌具有特化而重疊的代謝能力，主要代謝活性是發酵和分解花粉壁成分，還可調控胰島素信號通路影響蜜蜂的食慾和體重，刺激宿主免疫系統，通過定殖抗性減少病原體感染。

Functional roles and metabolic niches in the honey bee gut microbiota

2018-01-05 DOI: 10.1016/j.mib.2017.12.009

Microbiome：16S vs 宏基因組，對兒童克羅恩病的診療意義各異

Microbiome

[IF:8.496]

未經治療的兒童克羅恩病患者和對照個體各20名，取結腸樣本，用16S測序和鳥槍法宏基因組學（MGS）進行分析； 將這些數據按不同方式（菌群構成、KEGG通路等）分組，作為隨機森林機器學習演算法的輸入數據，用於給疾病狀態和治療反應分類； 整體而言，用基於16S的菌屬信息進行分類準確率較高； 鑒定出可作為標誌物的菌及菌群功能，用16S鑒定出的菌可較準確預測疾病狀態（如Akk菌），MGS鑒定出的功能相關標誌物可較準確的預測治療反應。

Multi-omics differentially classify disease state and treatment outcome in pediatric Crohn』s disease

ACA：如何破解宿主-菌群代謝組中的未知？(綜述)

Analytica Chimica Acta

[IF:4.950]

代謝組學中未被鑒定出的代謝物及其性質，「暗物質」，是一個具有巨大潛力和挑戰的前沿領域，需多組學的合作； 用質譜儀進行非靶向代謝組學分析是鑒定「暗物質」通常使用的方法； 對腸道菌群及其代謝組的系統性分析，是了解功能性微生物及未來利用其調控宿主表型（疾病）的必要前提； 結合高解析度質譜儀和計算分析，基於微流體學設計的人體細胞和微生物共培養系統HuMiX，在宿主-微生物代謝組學的研究中顯示出巨大潛力。

Dark matter in host-microbiome metabolomics: Tackling the unknowns–A review

2017-12-30 DOI: 10.1016/j.aca.2017.12.034

感謝本期日報的創作者：沈志勛，this little piggy，兵兵，mildbreeze，瀟洒小姐

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