維管植物的基因組見證了家族的病毒的進化

維管植物的基因組見證了家族的病毒的進化。

內源性病毒元素是整合到宿主細胞核基因組的病毒序列。它們是真正的分子化石，證明了數百萬年前可能發生的感染，研究它們可以幫助我們了解病毒是如何隨著時間進化的。

作為一項國際合作的一部分，CIRAD和INRA的研究人員研究了一種導致植物中大量感染的家庭科氏菌科病毒的內源性元素。他們研究了植物的基因組，以評估這些病毒及其宿主光譜的多樣性。

血管植物內的內源性病毒成分，從石松類到開花植物。

科學家們使用最先進的基因組學和生物信息學工具來分析72株的基因組特徵的代表不同的系統組日期——從綠色開花植物,藻類,尋找序列代碼的全部或部分的病毒蛋白家族Caulimoviridae既具體又高度保守,retrotranscriptase。雖然這種序列的存在在開花植物的基因組中是已知的，但它們也在大多數維管植物中發現了一些，包括最原始的植物——蕨類植物、針葉樹和石松類——這一結果表明了Caulimoviridae的能力可以感染一個廣泛的、之前被低估的宿主範圍。62種開花植物的研究,似乎內生Caulimoviridae的數量與基因組的大小相關,與成千上萬的序列的核心巨頭裸子植物的基因組,和明顯的例外:玉米(玉米)基因組沒有任何儘管它的大小。另一方面，蓖麻(蓖麻)和柑桔(柑橘)的密度顯著高。

內源性病毒元素與科氏家族新屬的關係，深入分析了在植物中發現的內源性病毒元素，發現大部分內源性Caulimoviridae來自於Florendovirus和Petuvirus。它也導致了以前不為人知的Caulimoviridae的進化分支的發現:在針葉樹中發現了四種新的家族Caulimoviridae(1到4種)，2種蕨類植物(Fernendovirus 1 and 2)和5種開花植物(如Xendovirus或Yendovirus)。

內源性病毒元素可以追溯到泥盆紀時期。

基於分布的分析不同病毒屬的植物物種的家庭Caulimoviridae研究,科學家們能夠提出進化的場景,在該場景中,這種病毒家族顯然出現在開花植物和裸子植物的祖先共享泥盆紀(- 3.2億年)。顯然，在不同部門的主人之間進行了後來的交流。值得注意的是,大型主機的病毒家族Caulimoviridae可能是由於這些病毒運動蛋白的存在促進了運輸和流通之間的病毒顆粒細胞通過特定渠道,或胞間連絲,其結構是維管植物的特徵。

這些結果證明了家族科的病毒對維管植物進化的影響。他們呼籲對這些病毒在植物基因組中的作用和後果進行更詳細的研究。

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