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面對失敗的抗生素,科學家正在使用殺手病毒來打擊超級細菌

微生物學家準備純化的噬菌體

處於無法控制的細菌感染危險中的患者可能會發現新的盟友:稱為噬菌體的殺手病毒。隨著DNA測序和人工智慧的發展,一些初創公司正在將這些細菌的天敵變成有希望的抗生素替代品。

隨著越來越多的細菌對我們今天使用的藥物產生抗藥性,迫切需要替代品。美國每年大約有兩百萬人感染耐葯菌,至少有二萬三千人死於感染。

噬菌體產生抗性的可能性要小得多,因為每一種噬菌體都會感染特定類型的細菌。使用它們來抵抗感染是一個古老的想法。但直到最近,找到正確的噬菌體類型還不止於猜測。有時候醫生會給病人注射噬菌體,它會起作用,有時候不會。

因此,噬菌體治療現在只用於最嚴重的患者,作為最後的手段治療。但是DNA測序和人工智慧可以使找到合適的噬菌體變得更容易,從而將這一策略轉化為更加實用的治療方案。

AmpliPhi Biosciences公司首席執行官Paul Grint說:「我們可以快速測序噬菌體,並說這是我們想要的確切的DNA序列。」該公司首席執行官,預先調配噬菌體的組合以治療細菌感染,如金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。他說:「理想的情況下,我們需要一種可以從冰箱里拿出來的產品給病人。

噬菌體的顯微鏡圖像,計算機著色的藍色

噬菌體常常生活在骯髒的地方,包括污水,所以科學家們首先要隔離和凈化它們。之後,AmpliPhi使用DNA測序來確保沒有遺漏可能有害的病原體的遺傳物質。

另一家創業公司Adaptive Phage Therapeutics公司希望利用AI為個體患者量身定做噬菌體治療。

該公司目前使用的實驗室測試需要至少八個小時,有時甚至一兩天,以讀取噬菌體或噬菌體對特定菌株的最佳效果。加上將噬菌體運送到醫院需要花費的時間,對於一些病人來說可能太長了,首席執行官Greg Merril說:「當病人病危時,每一分鐘都是重要的。

所以他的公司正在試圖自動化這個過程。它正在開發一種使用噬菌體和細菌基因組數據的機器學習演算法。研究人員正在對該系統進行培訓,以學習如何挑選能夠感染特定細菌株的噬菌體。

最終,Merril看到一個AI應用程序正在醫院中使用,並配有一個分配系統,可以識別最有效的噬菌體或噬菌體的組合,並在數分鐘內分配一個小瓶來處理病人。

這還有很長的路要走。目前,Adaptive Phage Therapeutics公司計劃在其馬里蘭州的辦公室使用AI系統來確定病人的最佳治療方案,從其收集中選擇合適的噬菌體,並將噬菌體送到醫院。

AmpliPhi和Adaptive Phage Therapeutics已經成功治療了二十餘名有生命危險的病症,目前正在美國食品和藥物管理局(FDA)批准的緊急使用許可下治療其他一些病人。

如果新方法奏效,噬菌體療法最終可能成為治療細菌感染的主流選擇。兩家創業公司正在計划進行臨床試驗,以測試他們的療法是否比當前的抗生素更好地擊敗細菌

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