2017單細胞測序重點事件盤點TOP10！

乾貨 | 靠譜 | 實用

來源： 博奧晶典

近年來，單細胞測序技術獲得快速發展，尤其是大通量單細胞轉錄組測序突破了傳統技術的低通量、高成本等局限；而其中基於微液滴技術的大規模單細胞分選平台的出現，更可一次性實現數十萬數量級細胞的表達圖譜構建，可用於解析各個器官或者組織細胞複雜的基因網路在單個細胞中的運作機制，可了解各個細胞中這些網路有何差異，以及各種細胞群體如何協同工作。

2017年，基於大規模單細胞測序技術的重磅研究取得豐碩成果，並且各項大型計劃的提出，更加「引爆」了大規模單細胞測序技術，指引生命科學研究進入單細胞測序新時代。

下面小編就來給大家盤點一下2017大規模單細胞研究大事件

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10X Genomics 助力大規模單細胞

轉錄組測序分析技術

2017年1月，10X Genomics 公司和 Fred Hutch 的團隊利用基於液滴的方法，讓單細胞轉錄組學研究得以加速，從單個細胞到群體單細胞研究，相關研究結果發表在《Nature Communication》。

這項新的單細胞RNA測序方法，可實現數千個免疫細胞或者其他類型細胞的分析。

《Cell》:中國學者團隊首次通過

大規模單細胞測序，發布肝癌免疫圖譜

2017年6月16日，中國學者團隊《Cell》雜誌發布重大研究成果，題目為「Landscape of infiltrating T cells in liver cancer revealed by single-cell sequencing」的研究論文，首次在單細胞水平上描繪了肝癌微環境中的免疫圖譜，深刻了解肝癌的腫瘤免疫微環境來探索新的腫瘤免疫療法及尋找新靶點和有效的生物標誌物，對於肝癌的診斷和治療具有重大意義。

這項研究結果，為構建其他腫瘤（肺癌等）的單細胞水平免疫圖譜提供了系統的研究方法和思路。

Nature 特刊，生命科學研究

進入大規模單細胞研究的生物學時代

2017年7月5日，《Nature》特刊發布單細胞測序進入生物學時代；Nature 聚焦於生命的最基本單位：細胞；單細胞測序技術的發展使我們能夠在單細胞層面繪製複雜機體的細胞圖譜，追蹤細胞世系以及發育和分化機制，探索機體中究竟存在多少類型的細胞、它們的作用及發展過程。

單細胞技術的快速發展，並將經典細胞生物學、發育生物學、基因組學和計算生物學引入單細胞層面，從而更加多維度分析複雜的細胞，探索細胞進入新的科研領域。

高通量的單核RNA測序新方法：sNuc-Seq，

引領生命科學研究

進入大規模單細胞核轉錄組測序

2017年8月28日，Nature Methods 雜誌發表題為《Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq》的文章，將sNuc-Seq技術與微流控技術相結合，可分析結構複雜的組織中大量細胞的細胞核RNA，進行大規模的基因表達檢測，引領生命科學研究進入大規模單細胞核轉錄組測序。其可應用於各種癌症和神經退行性疾病，如阿爾茨海默氏症或腫瘤的異質性，甚至正常腦老化過程的研究，以及「人體細胞圖譜計劃項目」。

促進精準醫學發展，

中國人血細胞分子圖譜研究聯盟成立

2017年9月，由中國醫學科學院北京協和醫學院和中國醫學科學院血液病醫院牽頭，成立人血細胞分子圖譜（Atlas of Blood Cells，ABC）研究聯盟，全面解析並繪製單細胞水平的正常人以及各類血液病患者的血細胞分子圖譜及其異質性規律。其目的是繪製中國首個人類生理、病理的血細胞圖譜，以期為國內外血細胞研究提供綜合參考目錄，為我國血液疾病早期診斷和治療提供新的技術及策略，使我國在國際細胞分子圖譜和血細胞研究領域實現率先理論突破和臨床轉化。

「人類細胞圖譜計劃」首批38個項目公布，

清華大學張學工團隊入選

2017年10月16日，與「人類基因組計劃」相媲美的「人類細胞圖譜計劃」 首批擬資助的38個項目正式公布。清華大學張學工負責的項目是其中唯一一個由中國科學家承擔的項目。主要方向：腦、免疫、組織處理、胃腸道、皮膚和技術研發等。

Science專刊：

Single-cell Genomics 獨領風騷

2017年10月，《Science》雜誌的封面特刊聚焦單細胞基因組學（Single-cell Genomics），從單細胞組學水平暢談了人類對免疫系統和腦神經系統的新認識，以及單細胞表觀遺傳學的新進展，並對「人類細胞圖譜」計劃寄以厚望。

解讀每個細胞的「指紋」，單細胞組學在行動

《科學》雜誌封面圖裡的科學家們用放大鏡就解開了單個細胞的遺傳學秘密；現實中的科學家們則需要依賴日益成熟的單細胞組學技術來解讀「指紋」信息。了解單個細胞層面的生命信息將協助揭開更多生命的奧秘。

《Nature》：大規模單細胞RNA測序

繪製首張高解析度小腸上皮細胞表達圖譜

2017年11月08日，由博德研究所和馬薩諸塞州總醫院領導的多中心研究小組於《Nature》期刊發布了首張高解析度的小腸上皮細胞基因表達圖譜，題目為《A singlecell survey of the small intestinal epithelium》，解析了腸道細胞產生的激素等其他信號物質，並為腸道如何應對病原體入侵提供了新的線索，其為後續構建其他組織或者器官的細胞圖譜提供系統的的方法和參考經驗。

《Cell》發布重大突破，

6000個單細胞轉錄組測序

繪製頭頸部癌症史上最清晰細胞圖譜！

Cell 雜誌11月30日在線發表了題為《Single-Cell Transcriptomic Analysis of Primary and Metastatic Tumor Ecosystems in Head and Neck Cancer》的文章，報道大規模單細胞轉錄組測序在頭頸部鱗狀細胞癌（HNSCC）中的研究結果。

該研究結果揭示了頭頸部腫瘤中存在部分上皮-間質轉變（p-EMT）的細胞，這些細胞從腫瘤組織整齊的結構中轉變成不規則的結構，然後被擠壓到周圍環境中，從而有可能侵入並擴散到身體的其他部位。這項研究創造了頭頸部腫瘤的第一個細胞圖譜，揭示了頭頸部腫瘤及其轉移的許多不同類型的細胞。

博奧晶典10X Genomics平台優勢

博奧晶典作為國內第一家引進10X Genomics平台的公司，在國內率先開展上萬級通量的單細胞轉錄組測序服務。目前已經完成了300多個樣品、30種不同樣品類型的服務，覆蓋的物種和樣品類型包括人和小鼠的肝臟、肺臟、皮膚、心臟、腦、腎臟、血液、卵巢、神經，以及雞、斑馬魚、豬、水稻、擬南芥、油菜、白菜、橄欖等，擁有豐富的項目經驗。此外，還在大規模單細胞轉錄組測序的數據挖掘上開發了很多新的流程，為單細胞轉錄組測序研究提供一站式服務。

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