CrLPAAT2 in ER居然偏好C16：0：我們以為的世界，並不是真實的世界

最新 02-09

大家都知道，衣藻的很多研究都是借鑒於高等植物

諸如菠菜啦，油菜啦，擬南芥啦，水稻啦等

所以幾十年來，做衣藻的人也一直認為

高等植物中一些經典的結論

同樣適用於衣藻

其中，我個人來說，最熟悉的，就是認為衣藻細胞內TAG合成主要有兩條途徑：原核途徑（prokaryotic pathway）和真核途徑（eukaryotic pathway）：

所謂原核途徑是發生在葉綠體（chloroplast）中

真核途徑發生在內質網（Endoplasmic reticulum, ER）中

那麼如何區分細胞里的TAG究竟是從哪條途徑來的呢？

在高等植物TAG合成途徑（下圖）中：

G-3-P-->lyso-PA-->PA-->DAG-->TAG

催化lyso-PA到PA的酶LPAAT是極關鍵的一個酶

而葉綠體中的LPAAT只喜歡C16:0這種脂肪酸

而內質網上的LPAAT只喜歡C18:1這種脂肪酸

所以只需要看一下TAG中中間那個脂肪酸

是16還是18就知道這個TAG是哪來的了。

這種高等植物界是經過反覆驗證了的人人都說好

在衣藻中人們發現葉綠體中的LPAAT確實是偏好C16:0的

更加確信了小衣藻是有乖乖滴履行植物大哥定下的規矩。

很多文章也就基於這樣的假設展開工作和推斷結論的

比如2011年的這篇經典的FEBS letters：

在這篇文章中，作者通過90%的TAG的sn-2位是C16脂肪酸，因此得出結論這些TAG都是從葉綠體來的：

但是，正如《火影忍者》中鼬的名言一樣

人都是依靠自己的感知和認知來認識這個世界

但也被自己的認知所束縛，並把它叫做真實

每個人都活在自己認識的世界中

2018年1月3號，PNAS發表了這樣一篇文獻：

在自己認知的世界裡，目前，如果只是characterize衣藻的一個基因，是很難發到PNAS上的。

不過當我看到這是ER上的的LPAAT卻偏好原核途徑的時候，我想，這樣的結果發在PNAS上也沒什麼不可以的。。。

畢竟，這樣的結果一來是大家之前都不曾想到的，二來很多之前的結論（衣藻擁有基於原核真核途徑合成TAG）這樣看來，就不那麼solid了。

文章工作量個人感覺並不算太多，首先對衣藻基因組中Cre17.g738350這個基因進行一些氨基酸預測以及亞細胞定位，發現這個基因雖然是CrLPAAT2，蛋白也確實定位在ER上，但是卻和CrLPAAT1有很大的同源性。

為了研究這個基因中細胞內的具體功能，他們用RNAi技術對這個基因進行了敲降，結果發現，和野生型相比，兩個敲降株RNAi1和RNAi2的中性脂含量顯著降低了，但是極性脂、膜脂含量並沒有顯著變化。同時，過表達結果也是類似的結果：這個基因在正常條件下對衣藻的TAG合成沒有顯著作用，但是在缺氮條件下負責大量的TAG合成。