2018 IHMC大會嘉賓：發表了250多篇SCI的人，究竟是何方神聖？

當苦逼的老博還在因畢業沒文章，而在實驗室埋頭苦幹的時候，有人卻已經發表了250多篇SCI（而且多篇被作為雜誌的封面文章），這究竟是何方神聖？（內心os : 我要抱大腿）

沒錯，此人就是被業內人士公認為微生物組和基因治療領域的領導者——Frederic Bushman教授，他也將在2018年6月26-28日舉行的第七屆國際人體微生物組大會（IHMC大會）上做報告。。

今天，小編就給大家介紹一下這位大咖以及他最新的研究狀況。

榮譽和稱號

「

美國科學促進會會士

美國微生物科學院院士

《人類基因治療》雜誌先驅獎

Frederic Bushman教授不僅是賓夕法尼亞大學是佩雷爾曼醫學院微生物學系的主席兼教授，同時也是一名兒科教授，對費城兒童醫院的微生物組計劃的建立起了重要作用。在Frederic Bushman教授近三十年的從業生涯中，不僅成功推動了艾滋病、微生物學和基因治療領域的研究發展，還被藍絲帶小組評為細胞和基因治療領域的十二位先驅者之一。

研究方向

他目前的研究主要集中在健康與疾病的宿主-微生物相互作用關係，尤其是利用新一代深度測序方法對人體微生物組、HIV發病機制以及人類基因治療中的DNA整合展開研究。

佳作賞析

Cell Host & Microbe：Inflammation, Antibiotics, and Diet as Environmental Stressors of the Gut Microbiome in Pediatric Crohn』s Disease

炎症、抗生素、飲食是兒童克羅恩病中腸道微生物組的環境壓力因素

摘要

克羅恩病（Crohn』s disease）的特徵之一就是腸道細菌組成異常，即腸道菌群失調。目前，治療克羅恩病的方式主要包括改變飲食和免疫抑製劑以及抗生素的使用，但對腸道菌群的影響尚未明確。

該研究中，Bushman教授等人跟蹤了接受腸內營養或抗體治療的兒童克羅恩病患者的治療過程，並利用鳥槍測序法分析糞便樣品中的細菌、真菌、古細菌以及病毒的狀態。結果表明，細菌與腸道炎症、抗生素的使用和治療直接相關。抗生素的使用會加劇腸道菌群失調，但隨著腸道炎症的減輕，菌群失調也將會有所緩解。而隨腸道炎症和抗生素的使用，兒童克羅恩病患者腸道內的真菌比例增加。此外，研究還發現，與其他治療方式相比，膳食療法對腸道微生物組成的影響具有獨立且快速的作用，並且可以有效地減少腸道炎症。

這些研究結果表明，腸道菌群失調是由腸道炎症、飲食和抗生素的獨立作用引起的，並隨著腸道炎症的減輕而減少。這些結果可能有助於生物標誌物的發現和為克羅恩病的治療提供線索。

mBio:Transfer of Viral Communities between Human Individuals during Fecal Microbiota Transplantation

糞菌移植中病毒在人供體和受體之間的傳播

摘要

糞菌移植（Fecal microbiota transplantation， FMT）是一種非常有效的治療艱難梭菌感染的方法，並且也已經取得了巨大的成功。然而，人們仍然擔心病毒等致病微生物會在糞菌移植過程中發生轉移，並且此前並未對糞菌移植過程中的病毒轉移展開研究。

該研究選取了1個健康個體作為FMT供體，3名小兒潰瘍性結腸炎（UC）患者作為FMT受體，每個患者在6至12周期間接受22-30次FMT治療。糞菌移植完成後，從供體和受體的糞便樣品中純化出病毒顆粒並測序。測序結果顯示，FMT供體體內的病毒contig可在受體體內檢測到，並且在受體中出現多達32種不同的供體病毒contig。不過，令人欣慰的是，這些病毒沒有一種是在人體細胞上進行複製的。此外，研究還發現有兩種轉移最為頻繁的基因類型與溫和噬菌體的複製有關，包括λ噬菌體在內的典型的溫和噬菌體組中的Siphoviridae轉移效率相對來說是最高的。

該研究結果表明，與宿主形成穩定結構的溫和噬菌體在FMT期間更易被轉移，並且未檢測到已知的感染人類細胞的病原性病毒。此外，用於製備和轉移糞菌的材料和方法的不同可能會影響病毒的傳播，所以通過深度了解病毒轉移的特點將有助於開發最安全的糞菌移植方案。

代表文章

1. Wu GD, Chen J, Hoffmann C, Bittinger K, Chen YY, Keilbaugh SA, Bewtra M, Knights D, Walters WA, Knight R, Sinha R, Gilroy E, Gupta K, Baldassano R, Nessel L, Li H, Bushman FD, Lewis JD: Linking long-term dietary patterns with gut microbial enterotypes. Science 334: 105-108, 2011.

2. Schr?der AR, Shinn P, Chen H, Berry C, Ecker JR, Bushman F: HIV-1 integration in the human genome favors active genes and local hotspots. Cell 110: 521-529, 2002 Notes: see also cover.

3. Bushman FD, Fujiwara T, Craigie R: Retroviral DNA integration directed by HIV integration protein in vitro. Science 249: 1555-1558, 1990.

供稿：高燕

編輯：張洪春

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