非編碼基因的崛起
長編碼RNA
基因空間
2018.02.09(星期五)
非編碼基因根據其功能範圍可以分為兩類,即主要起調控功能的調控RNA,以及在翻譯中起實質作用的核糖體RNA和轉運RNA;後者發現得比較早。這些基因的特點是經轉錄後形成RNA,以RNA為主要的作用形式,而不是翻譯成蛋白質後再起作用。
核糖體RNA在細胞內最重要的一類大分子,占細胞乾重的60%;相對之下蛋白質只佔不到40%。核糖體RNA與數十個蛋白質一起,組成核糖體,負責在翻譯時將單個的氨基酸連接到合成中的肽鏈上。轉運RNA是將編碼基因翻譯成蛋白質的重要分子,它的一端用於識別編碼基因上的密碼子,另一端則連著密碼子相對應的氨基酸。這兩類非編碼基因具有具體的功能,在基因科學史上也發現較早。
另一類非編碼基因主要起調控作用,它們大都通過序列互補與目標基因或序列結合,形成穩定的雙鏈結構從而抑制目標基因的活性或者穩定性。有些雙鏈結構還能被酶識別、切割,然後釋放出來的非編碼基因重新使用。相比蛋白質,非編碼基因對目標的調控有著直接快速的特點;另外,有些非編碼基因較短,可以一次識別較多的目標基因,因此也有廣譜性的特點。
非編碼基因的研究起始於轉基因靜默(transgene silencing)效應的研究。科學家們在1989年於植物中發現,外源基因轉入到細胞內後,有一些不能發揮作用,被「靜默」了。次年,科學家們就證明了這種調控的原理是由序列互補(又稱反義RNA)。即細胞本身會產生一些與外源基因互補的序列,相互配對,以沉默外源基因。
事實上,大部分非編碼基因都是通過這種方式行使其功能的。
1992年,與X染色體去活化相關的非編碼基因XIST被發現了。在女性的細胞中有兩個X染色體;但通常只有一條是活躍的,另一條活性被抑制並包裝成異染色質,即通常所說的失活。XIST參與了X染色體失活的過程。
異染色質的特點是高度濃縮,染色後在顯微鏡下能夠很明顯的看到。女性細胞的這種特點被用來分辨胎兒的性別,即先抽取孕婦羊水,再分離出胎兒細胞,然後進行染色,就能夠通過有無異染色質化的X染色體來確定胎兒的性別。
20世紀最後的幾年裡,先後發現了一些重要的短非編碼RNA基因,包括microRNA和small RNA(比microRNA長一些,但一般長度也較短)。microRNA一般22個鹼基左右,存在於植物、動物和病毒當中。
與目標RNA(蛋白編碼基因)以互補方式結合後,通過以下三種方式之一發揮作用:a) 結合的mRNA被切割;b) 降低結合的mRNA的穩定性;c) 降低目標mRNA的翻譯效率。在植物中,microRNA全長與目標mRNA互補性結合,然後誘導目標的切割。
但是在動物當中,通常只由microRNA的5端6~8鹼基與目標mRNA互補結合;這段鹼基序列被稱為種子區域,但結合後的雙鏈結構不足以引發mRNA被切割。在動物中,兩個以上microRNA同時作用相同mRNA的情況比較普遍。由於microRNA的種子區域較短,在mRNA序列中隨機出現的可能性較高;因此一個microRNA通常有很多個目標基因;一個mRNA也可能由多個microRNA同時作用。
非編碼基因是細胞的正常組成部分,其序列突變或者表達失調後可能會引起疾病。比如,miR-96基因的種子區突變時,可能引起遺傳性的進行性聽力喪失;miR-184的種子區的突變會引起遺傳性的圓錐角膜和前極白內障;miR-17~92家族成員的缺失會造成骨骼及生長方面的缺陷。此外,研究表明,許多microRNA與腫瘤有著密不可分的聯繫。
近些年,人們又發現了所謂的長非編碼RNA,打破了傳統上認為的非編碼基因通常較短的認知,進一步擴展了非編碼基因家族。長非編碼RNA的調節方式及其具體的功能目前還在進一步研究當中。


TAG:基因空間 |