分離RNA有了新工具，有助於揭開基因組中的「暗物質」

北京時間2月13日零點，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院在Nature Methods（《自然 · 方法學》）雜誌在線發表了分離RNA結合蛋白的新技術，該技術是全面分析細胞內的RNA－蛋白相互作用的重要工具，有助於揭開基因組中的「暗物質」－非編碼RNA的未知功能。

有數以百計的蛋白質可以與RNA結合，其中很多涉及神經退行性病變、自身免疫缺陷和癌症等疾病。那麼，如何系統地分離RNA結合蛋白的問題變得引人注目。前期科學家們系統地分離了細胞內mRNA結合蛋白，這只是眾多轉錄本中的一部分，細胞還包含了很多非polyA RNA。

廣州生物院研究員 Miguel A. Esteban（米格爾·埃斯特班）、張必良和副研究員鮑習琛領銜的科研團隊設計了RICK（Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry）技術，利用核酸標記技術，巧妙地將新合成的RNA標記上生物素，通過鏈霉親和素偶聯的磁珠，分離得到相應被標記RNA分子和與其相結合的蛋白分子。

通過這一技術，研究人員系統地分離了包括非polyA尾RNA和新生RNA在內的一系列RNA分子及其結合蛋白。進一步分析發現，細胞分裂調控因子作為新的RNA結合蛋白，存在結合非polyA尾RNA的潛能。研究人員縮短標記的時間，成功地在細胞中分離了新生RNA結合蛋白。這些蛋白與新生RNA的轉錄及後續的加工、剪切等調控密切相關。這一技術的應用將有助於深入地剖析RNA結合蛋白的作用機制，也是細胞命運轉變過程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。

研究工作獲得國家重點研發計劃項目、國家自然科學基金委、廣州珠江科技新星、中科院青年創新促進會等項目的資助。

RICK技術原理圖

來源：中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院

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