宏基因組學基本介紹

宏基因組（元基因組）學研究不要求對每個微生物進行分離純化培養，而是直接從樣品中提取基因組DNA後進行測序分析。通過宏基因組（元基因組）測序，能夠解釋微生物群落多樣性、種群結構、進化關係、功能活性及環境之間的相互協作關係，極大地擴展了微生物學研究範圍。

基本概念：

宏基因組（Metagenome）：生境中全部微小生物遺傳物質的總和，它包含了可培養的和未可培養的微生物的基因組

宏基因組學（Metagenomics） ：以研究生境中微生物的種群結構、 進化關係、 功能活性、 相互協作關係及與環境之間的關係為目的的微生物研究方法。

研究對象：環境樣品中的微生物群體基因組

研究手段：測序分析

研究目的：微生物多樣性、種群結構、進化關係、功能活性、相互協作關係及與環境之間的關係

實驗流程：

進行宏基因組測序，首先需要進行環境樣本總DNA的提取。經過DNA質檢、機械打斷、片段選擇、末端修復、接頭連接、產物純化構建小片段文庫，再進行上機測序。

宏基因組能解決的三個層次的問題：

（1）菌群

通過對樣本中所有微生物的DNA進行宏基因組測序，可以獲取微生物的群落結構組成，並對各物種的丰度信息進行統計，為差異菌群的篩選提供基礎。同時，可以對單純環境中高峰度的菌種進行基因組重構，發掘新物種。

（2）基因

通過對測序Reads進行拼接和ORF預測，得到微生物中具有潛在功能活性的基因；同時在分子水平進行樣本間差異基因的比較分析，以推測功能上的相似性或差異性；

（3）功能

通過基因的功能代謝注釋，深入剖析生物分子之間的相互作用機制，揭示潛在的生物學意義。

市場部李朦 文案

市場部潘旭蘭 編輯

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