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circRNA研究最近有哪些新進展?

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circRNA cSMARCA5抑制肝細胞癌的生長和轉移

Circular RNA cSMARCA5 inhibits growth and metastasis in hepatocellular carcinoma

期刊:Journal of hepatology

影響因子:12.486

作者單位:中國人民解放軍第二軍醫大學

文章內容

景及目的:近年來,circRNA已被證明在癌症生物學中具有重要的調控作用。然而,circRNA對肝細胞癌(HCC)的作用仍未清楚。

方法:通過RNA測序找到cSMARCA5(來自SMARCA5的第15和16個外顯子的circRNA, hsa_circ_0001445),並通過QPCR進行驗證。cSMARCA5在HCC進展中的作用在體內和體內都有評估。體內外實驗研究cSMARCA5在HCC進展中的作用。採用circRIP、熒光素酶報告實驗、biotin-miRNA捕獲和FISH研究cSMARCA5與miR-17-3p/miR-181b-5p之間的相互作用。

結果:cSMARCA5的表達在HCC組織中較低,原因是受到一種豐富的核RNA解旋酶DHX9的調控。HCC中cSMARCA5的下調與侵襲性特徵顯著相關,是肝切除術後肝癌患者總體生存(OS)和無複發生存率(RFS)的獨立危險因素。體內外實驗的數據表明,cSMARCA5抑制HCC細胞的增殖和遷移。機制研究發現cSMARCA5可以通過海綿miR-17-3p和miR-181b-5p促進TIMP3的表達。

結論:這些結果揭示了cSMARCA5在HCC生長和轉移中的重要作用,為HCC進展中的circRNA提供了新的角度。

總結:cSMARCA5是一種環狀RNA,抑制HCC的生長和轉移,可能是HCC的潛在治療靶點。

2

急性髓系白血病中含MYC的擴增體:基因組結構、進化和轉錄結果

MYC-containing amplicons in acute myeloid leukemia: genomic structures, evolution, and transcriptional consequences

期刊:Leukemia

影響因子:11.702

作者單位:義大利巴里大學

文章內容

雙微體(dmin)、均質染色區域及環狀染色體是癌症基因擴增的載體。在急性髓系白血病(AML)中,導致其形成的潛在機制以及其結構和功能仍然未知。作者結合一系列高解析度基因組方法研究了23例AML (AML-amp)中染色體組8q24的擴增結構和表達模式。結果發現不同的MYC-dmin體系結構可以在相同的白血病細胞群中共存,這表明了它們經過逐步的進化而不是單一來源,例如通過染色體的碎裂。染色體組態標準的分析證實了本結果。此外,作者還發現,dmin可通過新著絲點向穩定的環狀染色體進化。令人驚訝的是,擴增基因(主要是PVT1)經常參與缺乏相應DNA模板的融合基因。在AML-amp病例中,作者也發現了PVT1 的circRNA (circPVT1)與正常核型的明顯過表達。研究結果顯示,在AML中,8q24的擴增子是塑料DNA結構,與新的融合基因和circRNA有著意想不到的聯繫。

3

circRNA及其在疾病中的作用機制:從實驗室到臨床

Circular RNA and its mechanisms in disease: From the bench to the clinic

期刊:Pharmacology & therapeutics

影響因子:11.127

作者單位:東南大學

文章內容

circRNA作為功能角色的出現,使我們對細胞生理學和疾病發病機制的認識有了新的認識。它們的序列構成決定了circRNA的生物發生模式。它們的豐富性、穩定性和物種間的進化保護具有許多潛在的功能,例如充當miRNA海綿或與RNA相關蛋白結合,形成調控基因轉錄的RNA蛋白複合物。此外,circRNA已被證明以一種組織特異性的方式和病理條件表達,這激發了人們對其在人類疾病和癌症中的作用的極大興趣。在這篇綜述中,作者概述了circRNA的特性、作用和作用機制以及它們對不同疾病的影響。雖然它們的確切作用和基因調控機制尚待闡明,但circRNA在疾病生物標誌物和新的治療靶點上具有潛在的應用價值。

4

circRNA在正常和疾病條件下作為細胞功能的新調控因子

Circular RNAs as novel regulators of beta-cell functions in normal and disease conditions

期刊:Molecular metabolism

影響因子:6.799

作者單位:瑞士洛桑大學

文章內容

目的:有充分的證據表明,不同類別的非編碼RNA,包括miRNA和lncRNA,在細胞活動和糖尿病發展的調控中都存在。最近發現的circRNA構成了哺乳動物轉錄組的很大一部分,但這些ncRNA在生理和疾病過程中的作用仍是未知的。本研究的目的是識別在胰島中表達的circRNA,並闡明它們在控制β細胞功能的可能作用。

方法:採用晶元方法識別人胰島中表達的circRNA,並從小鼠胰島的RNA測序數據中尋找其直系同源基因。然後,作者檢測了1和2型糖尿病模型胰島中4個候選circRNA的表達水平,並分析了這些環狀轉錄本在胰島素分泌、細胞增殖和凋亡調控中的作用。

結果:作者鑒定出了數千個在人胰島中表達的circRNA,其中497個亦存在於小鼠胰島中。其中circHIPK3和ciRS-7/CDR1as的表達水平在糖尿病db/db小鼠胰島中下調。在野生型動物胰島中減少其表達會導致胰島素分泌受損、β細胞增殖和生存能力減少。ciRS-7/CDR1as可通過阻斷miR-7來發揮作用。轉錄組分析顯示,circHIPK3通過結合miRNA發揮作用,其中包括miR-124-3p和miR-338-3p,還可通過調控β細胞的關鍵基因的表達,如Slc2a2, Akt1和Mtpn。

結論:研究結果表明,circRNA在糖尿病中作為β細胞的新調控因子參與細胞功能障礙。

5

circRNA在腫瘤免疫調節和免疫治療中的潛在作用

The Potential Role of circRNA in Tumor Immunity Regulation and Immunotherapy

期刊:Frontiers in immunology

影響因子:6.429

作者單位:中南大學

文章內容

ncRNA可分為circRNA和線性ncRNA。ncRNA存在於不同的細胞類型中,包括正常細胞、腫瘤細胞和免疫細胞。線性ncRNA,如lncRNA和miRNA,在腫瘤免疫和免疫治療的調控中發揮重要作用;然而,circRNA在腫瘤免疫和免疫治療中的作用尚不清楚。在此,作者回顧了ncRNA在腫瘤免疫和免疫治療調控中的現狀,重點討論了circRNA作為腫瘤抗原在腫瘤免疫和免疫治療中的潛在作用。

6

沉默circRNA hsa_circ_0000977可刺激miR-874-3p和抑制PLK1表達從而抑制胰腺導管腺癌的進展

Silencing circular RNA hsa_circ_0000977 suppresses pancreatic ductal adenocarcinoma progression by stimulating miR-874-3p and inhibiting PLK1 expression

期刊:Cancer letters

影響因子:6.375

作者單位:南方醫科大學

文章內容

circRNA是一種新型的內源性非編碼RNA,它通過與miRNA相互作用來調控靶基因的表達。越來越多的證據表明,circRNA的失調在生物學和病理過程中起著重要的作用,包括癌症的發生髮展。但circRNA在PDAC(胰腺導管腺癌)中的功能作用有待進一步研究。在本研究中,高通量晶元檢測並通過QPCR證實hsa_circ_0000977在胰腺癌組織中異常上調。抑制hsa_circ_0000977可抑制胰腺癌細胞增殖和誘導細胞周期阻滯,而且hsa-miR-874-3p mimic具有同樣效果,hsa-miR-874-3p抑製劑則具有相反作用。生物信息學分析預測,在胰腺癌發展過程中存在hsa_circ_0000977/has-miR-874-3p/PLK1軸。雙熒光素酶報告系統和FISH分析驗證了hsa_circ_0000977、hsa-miR-874-3p和PLK1的直接相互作用。Western blot證實抑制hsa_circ_0000977可抑制PLK1表達。此外,抑制hsa_circ_0000977可在體內抑制胰腺癌的生長。總之,沉默hsa_circ_0000977可通過與hsa-miR-874-3p相互作用並抑制PLK1的表達從而抑制胰腺癌的進展。本結果可能為胰腺癌的未來診斷和治療提供策略。

7

circRNA:癌症診斷和治療的新領域

Circular RNAs: a new frontier for cancer diagnosis and therapy

期刊:Journal of hematology & oncology

影響因子:6.35

作者單位:中國醫科大學第一附屬醫院

文章內容

近年來,circRNA在癌症生物學的許多領域發揮了重要作用,引起了廣泛的關注。此外,circRNA有可能為個性化癌症藥物的成功應用做出貢獻。這篇簡短的綜述闡述了circRNA作為生物標誌物和治療靶點的潛力,並討論了針對它們的可能策略。這篇綜述也提出了circRNA在臨床實踐中所遇到的挑戰。我們對circRNA的理解有助於為癌症的分子結構增加一個新的維度,並將為癌症治療提供許多新的機會。

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