科學家們開發了鑒定肝癌剪接生物標誌物的方法

根據冷泉港實驗室研究，研究人員已經開發出一種鑒定最常見形式的肝癌 - 肝細胞癌（HCC）的基於剪接的生物標誌物的方法。由Adrian Krainer教授領導的研究人員相信，該方法也可用於其他癌症類型。由於肝癌特別多樣，遺傳且容易複發，因此鑒定可預測疾病進展的生物標誌物是抗擊疾病進展的關鍵目標。這項研究強調了學習RNA剪接變體如何促成癌症的潛力，並指出這些變體是癌症進展的潛在生物標誌物，」Krainer說。

拼接指的是這樣的過程，其中從基因中編碼的信息複製的RNA信息在其能夠作為製造特定蛋白質的藍圖之前被編輯。一個基因可以產生多個RNA信息，每個信息產生不同的蛋白質變體或「異構體」。許多疾病與RNA拼接方式的錯誤或變異有關。剪接中的錯誤或變化可導致具有不同或異常功能的非功能性蛋白質或蛋白質。最近的研究已經確定了肝癌細胞中的剪接不規則性。在研究員Kuan-Ting Lin的帶領下，Krainer的團隊開發了一種方法，可以全面分析由給定基因產生的所有RNA信息。

該團隊通過分析從數百名患者採集的HCC細胞中的RNA信息，在HCC中測試了他們的剪接變體檢測方法。他們發現AFMID基因的特定拼接同種型與很差的患者存活相關。這些變體導致細胞製造截短版本的AFMID蛋白。這些不尋常版本的蛋白質與成人肝癌細胞有關，並在腫瘤抑制基因TP53和ARID1A中發生突變。研究人員假設，這些突變與稱為NAD +的分子的低水平有關，該分子參與修復受損的DNA。他們提出，將缺失部分（稱為外顯子）恢復到AFMID的正常RNA信息，可能會將NAD +提高到正常水平，從而避免TP53和ARID1A發生突變。

該團隊希望使用可與RNA結合的稱為ASO的小分子（反義寡核苷酸）來改變AFMID的RNA信息拼接方式。Krainer的研究小組以前曾使用這種技術來糾正基因SMN2剪接中的錯誤，以此作為治療脊髓性肌萎縮（SMA）的一種方法。修復AFMID拼接可能導致NAD +的產生增加和DNA修復的增加。 「如果我們能做到這一點，AFMID拼接可以成為治療靶點和肝癌新葯的來源，」林說。該研究發表在Genome Research雜誌上。

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