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微軟發布雲端基因服務:推動AI驅動的精準醫療

編者按:兒童癌症是很多研究者十分關注的問題,對相關數據的利用和處理無疑是解決問題的關鍵。近日,微軟宣布推出Microsoft Genomics服務,該服務通過幫助研究者利用和處理基因數據來取得治療癌症等疾病的重大突破。這一基於雲的工具讓存儲和計算龐大的基因數據成為可能。一起來看看吧!

本文譯自Microsoft announces general availability of cloud-based tools for genomics research,有刪減。

每年,全世界大約有175,000名14歲及以下的兒童被診斷出癌症,如何使用基因技術尋找齣兒童癌症的治療方法成為全世界研究者們十分關心的問題。但由於所需的基因數據規模和數量過於龐大,人們很難為他們的研究找到合適的數據。如果全世界的研究者都能夠輕鬆簡單地獲取並使用共享的基因組數據,這個醫學難題是不是會更容易被攻破呢?

孟菲斯聖裘德兒童研究醫院(St. Jude Children』s Research Hospital)的一個研究團隊從2010年就開始將患者的健康和癌症細胞的匿名數據上傳到了公共資料庫,嘗試通過推動全球研究機構數據共享的方法來尋找齣兒童癌症的治療方法。而當時,微軟正在制定一個基於雲的計算流程,用於對比數以百萬計的原始基因數據和參考基因數據,進而探明它們之間的不同之處。因此,雙方在這一領域展開了合作。

基於這項工作,微軟近日宣布推出Microsoft Genomics服務。Microsoft Genomics服務通過利用和處理基因數據,來幫助醫學研究者發明更精準地治療癌症等疾病的藥物。比如,通過分析患者的健康和腫瘤細胞組織以及其他患者的醫療數據(包括治療方法和結果),醫生能夠選擇最有效的治療方案。

Microsoft Genomics團隊

事實上,聖裘德兒童研究醫院、微軟以及DNAnexus(一個運營在Azure上的基因數據管理平台)三方基於共享基因數據以及Microsoft Genomics服務,合作開發了一套基因組比對和基因變異識別的流程。基於這套流程,合作者們已經處理了超過500TB的基因數據,並將其存儲在Azure以供大家分析。對於研究醫院、DNAnexus和微軟正在合力建立的數據分享平台來說,這些數據分析結果提供了一個良好的基礎。

Microsoft Genomics服務是微軟Healthcare NExT的一部分,Healthcare Next是微軟發起的通過人工智慧和雲計算來加速健康保健行業的創新。在擁有大量準確醫療數據的前提下,微軟希望通過部署在雲上的AI工具來幫助研究者更快地發現癌症等疾病的治療方法。而一個處理基因數據的通用流程,可以有效降低可能影響數據的偽影和噪音,有助於AI驅動下的精準醫療。

單一人類基因組測序的成本已經從2001年的一億美元降為如今的不到1000美元,成本的降低極大地加速了基因測序的商業化。據業內專家預測,到2025年,將會有超過1億人的基因組被測序。大量的測序需求的出現對計算機的計算和存儲能力提出了新的要求。

單個人類基因組數據約佔用100GB的存儲空間,需要花費個人筆記本電腦幾百個小時來處理這些數據。而隨著越來越多的基因組將被測序,存儲需求將達到PB甚至EB級別(1TB=1024GB,1PB=1024TB,1EB=1024PB)。面對如此龐大數據量,個人電腦將無能為力。因此,擁有海量存儲空間和強大計算能力的雲成為基因數據處理的完美工具。

目前,Microsoft Genomics已經面向美國、西歐和東南亞的用戶提供服務。由於基因數據處理通常會涉及到一系列法律和道德問題,為了保證數據的隱私和安全,Microsoft Genomics服務已經獲得了ISO認證,這意味著其達到了國際安全、隱私和質量標準。該服務同樣符合HIPAA(Health Insurance Portability and Accountability,健康保險攜帶和責任)法案標準,確保個人健康信息的安全使用。

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