不可忽視：骨髓移植治療帶來的腸道菌群損傷

今天是第677期日報。

Nature Reviews：同種異體造血幹細胞移植中的腸道菌群損傷（綜述）

Nature Reviews Cancer

[IF:37.147]

① 同種異體造血幹細胞移植（allo-HSCT）中，可危及生命的主要併發症包括移植物抗宿主病（GVHD）、複發和感染；② allo-HSCT後，腸道菌群多樣性顯著下降，感染併發症增加；③ allo-HSCT破壞腸道屏障與穩態，GVHD及抗生素的使用損傷腸道菌群，菌群代謝可影響宿主免疫應答，短鏈脂肪酸（SCFA）等起保護作用；④ 使用窄譜抗生素、益生菌、益生元等有益於腸道菌群；⑤ 腸道菌群調控宿主免疫，可做為預防複發和改善allo-HSCT總體生存期的靶點。

Gut microbiota injury in allogeneic haematopoietic stem cell transplantation

02-16 DOI: 10.1038/nrc.2018.10

COB：人體微生物組中的系統生物學（綜述）

Current Opinion in Biotechnology

[IF:9.294]

① 人體微生物組學是系統生物學不可或缺的一部分，用於探究其特徵的方法包括擴增子序列、宏基因組測序、轉錄組學、宏蛋白組學、空間結構視圖法和代謝組學；② 一個未知且不能由單個要素預測的複雜系統（如人體微生物組）的特性成為突現特徵，它是解開系統診斷和治療的關鍵因素；③ 多種研究方法基於基因型分型、微生物特徵、靜態數據和動態數據；④ 人體微生物組中的系統生物學仍有巨大發展空間，其終極目標是建立基於微生物組的診斷和治療。

Systems biology of the human microbiome

02-13 DOI: 10.1016/j.copbio.2018.01.018

Gut：胃食管反流病的全球患病率及風險因子

Gut

[IF:16.658]

① 對102項胃食管反流病相關研究進行薈萃分析，其中包括了108個研究人群（超過46萬人）；② 胃食管反流病的患病率在不同國家間差異較大，中國的患病率僅為2.5%，而希臘的患病率高達51.2%；③ 以每周一次的胃灼熱或反胃為標準，全球的胃食管反流病的患病率13.3%；④ 胃食管反流病患病率較高的人群為：50歲以上人群、吸煙人群、非甾體類抗炎葯（NSAID）/阿司匹林使用者、肥胖人群。

Global prevalence of, and risk factors for, gastro-oesophageal reflux symptoms: a meta-analysis

2017-02-23 DOI: 10.1136/gutjnl-2016-313589

Nature子刊：牙周炎中的T細胞，殺敵一千自損八百

Nature Communications

[IF:12.124]

① 在自身免疫性關節炎中，致病性Th17細胞引起骨破壞及自身免疫性炎症，但T細胞引起的骨損傷是否存在有益功能尚未明確；② 研究發現在牙周炎小鼠模型中，骨損傷性T細胞在細菌清除中發揮了關鍵作用；③ 細菌入侵導致Th17細胞產生，後者通過激活粘膜免疫反應以對抗細菌，同時導致骨損傷，骨損傷通過除去牙齒抑制感染；④ 骨損傷性T細胞可通過誘導牙齒脫落以終止局部感染，同時也可誘導骨骼組織退化，是一把雙刃劍。

Host defense against oral microbiota by bone-damaging T cells

MI：口服霍亂疫苗產生的免疫力不僅限於腸道

Mucosal Immunology

[IF:7.478]

① 健康成年志願者口服兩種劑量的霍亂疫苗Dukoral?，分析血液、唾液、鼻腔洗液、糞便中的疫苗特異性抗體；② 並分析淋巴細胞向小腸、結腸、呼吸道、皮膚、外周的歸巢；③ 口服疫苗後可在血清及鼻腔洗液中檢測到霍亂毒素B（CTB）及Dukoral?的特異性抗體；④ 18天時外周血及組織中的CTB特異性記憶B細胞歸巢達到頂峰；⑤ IgA+記憶B細胞可歸巢至呼吸道及結腸中，IgA-記憶B細胞可歸巢至小腸中，提示口服霍亂疫苗對不同位點的粘膜免疫反應有著不同效應。

Oral cholera vaccination promotes homing of IgA+ memory B cells to the large intestine and the respiratory tract

農大：環境菌群如何影響清香型白酒的自然發酵

Scientific Reports

[IF:4.259]

① 清香型白酒由傳統的自然固態發酵產生，生產時期影響白酒的香味；② 分析環境菌群、酒麴、發酵過程對香味的影響；③ 暑假過後生產的清香型白酒的酯含量及酸度顯著降低，可能來自於乳桿菌屬的結構差異；④ 相關性分析提示乳桿菌屬與酯含量呈正相關，物種分析顯示發酵罐表面耐酸乳桿菌的缺失可能造成發酵的遲滯及酯含量降低；⑤ 發酵過程中使耐酸乳桿菌在發酵罐表面重新富集可促進酯的形成，空氣及發酵罐是耐酸乳桿菌的重要來源。

Effect of the environment microbiota on the flavour of light-flavour Baijiu during spontaneous fermentation

中山大學等：菌群功能基因多樣性或可預測地下水污染

mBio

[IF:6.956]

① 利用功能基因晶元分析美國橡樹嶺野外研究中心的地下水菌群；② 提出假設：環境污染（鈾、硝酸鹽等）、pH值變化可降低地下水菌群的功能多樣性，並增加某些可利用污染物或對污染物有抗性的種群；③ 結果發現：鈾（而非硝酸鹽）的增加可降低地下水菌群的功能丰度/多樣性；④ 鑒定出隨鈾及硝酸鹽水平增加而顯著增加的特定功能性種群，可利用這些種群及相應的功能基因預測地下水的污染及生態系統功能。

Microbial Functional Gene Diversity Predicts Groundwater Contamination and Ecosystem Functioning

02-20 DOI: 10.1128/mBio.02435-17

Nature子刊：蛙壺菌感染改變產婆蟾的皮膚菌群

Nature Communications

[IF:12.124]

① 收集來自患有壺菌病的比利牛斯山產婆蟾的皮膚相關細菌及蛙壺菌，分為enzootic及epizootic兩組；② 發現不同生活階段的皮膚菌群存在差異，僅有少數分類群保持不變，提示變態過程中的皮膚菌群重構；③ 感染史對變態後的產婆蟾的皮膚菌群有顯著影響，epizootic種群的皮膚菌群多樣性降低，且組成及功能發生變化；④ 對蛙壺菌分離株的基因組測序結果顯示，比利牛斯山的致病蛙壺菌為單一來源，致病菌的遺傳學特性與流行病學趨勢無關。

Amphibian chytridiomycosis outbreak dynamics are linked with host skin bacterial community structure

感謝本期日報的創作者：花開，陳綺翎，沈志勛

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