想成為PubMed高手必會的9個技巧
轉載請註明:解螺旋·臨床醫生科研成長平台
Pubmed作為國際上公認的最具權威的生物醫學文獻資料庫,是科研者文獻搜索的重磅利器。因而為了讓各位實驗新手快速晉級為玩轉Pubmed的科研達人,本文則將壓箱底的10大絕招傾囊相授,希望能助大家一臂之力。
1
廣撒網,多撈魚
在科研課題決定之初,利用Pubmed進行充分的文獻調研早已是一件家常便飯的事情,然而讓人頭疼是,在搜索關鍵詞後,跳出的結果大多不是自己想要的劇情,很多與關鍵詞不匹配的文章充斥其中,無疑加大了研究者文獻篩選的工作量。
舉個栗子,打開Pubmed網頁之後,在檢索框中,輸入Inflammatory bowel disease TNF後,點擊「Search」或按Enter鍵,結果如下圖所示。
顯然,對於輸入Pubmed的多詞片語,它會查詢片語索引,如果查到相應片語會將其作為一個檢索詞來檢索,但如果沒有查到相應片語,則會將其拆分成單個詞分別檢索。所以Inflammatory bowel disease TNF就相當於Inflammatory AND bowel AND disease AND TNF。
如果不想把片語分開咋辦?方法很簡單,四個錦囊妙計送給你:1)加雙引號:「Inflammatory bowel disease」TNF;2)加標段標識[tw]:Inflammatory bowel disease[tw] TNF;3)加短橫線:Inflammatory-bowel-disease TNF;4)加截詞符*:Inflammatory bowel disease* TNF
2
查缺補漏,MeSH是「大功臣」
但是問題又來了,Inflammatory bowel disease還有一種縮略寫法IBD,上面的搜索方式無疑會漏掉一些文獻,而且還有一些關鍵詞還會有很多同義詞,不是一次性搜索就會全部出現的。此時,Pubmed里的一款總結同義詞的利器——MeSH霸氣上線了。
以liver cancer lncRNA為例,在MeSH里輸入liver cancer,就會跳出主題詞liver Neoplasms,這名詞看上去可就高大上多了。
點擊第一個主題詞liver Neoplasms後,可尋找相應的副題詞並進行打鉤後,點擊右邊上的「Add to Search builder」加到你的關鍵詞構建(PubMed Search Builder)中。這樣第一條關鍵詞就是「肝腫瘤的遺傳學分析」
然後不要退出,繼續輸入關鍵詞lncRNA,也通過「Addto Search builder」加到關鍵詞構建中,這個時候需要注意的是,用「And」這種邏輯語言的話,就代表求交集了,當然還可以自主換別的邏輯語言。構建完你的關鍵詞之後,點擊了「SearchPubMed」就OK了。
3
精確檢索文章
當然你要是有所針對的或特異性的搜索具體作者、雜誌或者其他信息等,還可以進行更加高級的檢索,點Advanced就可以了!
進去之後是個這個界面,檢索之後的步驟就是一樣的了:
又或者,在Pubmed的主頁面中,點擊Pubmed Tools中的Single Citation Matcher,進入以下界面,輸入特定的雜誌、日期、作者名字(第一作者或通訊作者)即可靶向某篇特定的文章。
4
獲取全文攻略
另外,LinkOut-more resources這裡也可以鏈接到資料庫,若資料庫中的有全文鏈接,也可直接點擊PDF進行下載。
5
臨床研究文獻檢索
一般,Pubmed檢索出的整體結果是未經分類,研究者需自行閱讀分類或使用filter(濾器)自行篩選。因而,若想查看具有針對性的臨床研究文章,也需花費大量的時間和精力。但是Pubmed主頁里Pubmed Tools中的Clinical Queries可讓研究者簡便快捷的找到相關文獻。
點擊後,可進入以下界面,其中包括了三大板塊:Clinical Study Categories(可選擇病因、診斷、治療、預後和臨床預測指南等)、Systematic Reviews和Medical Genetics(臨床遺傳學)。
選擇右下的see all,回到PubMed主頁。輸入你的二級關鍵詞:TNF,點擊搜索文章即可。
6
追蹤最新文獻
首先sign in to NCBI,即登陸「My NCBI」,沒有的小夥伴可以註冊一下。其次在搜索框中輸入breast cancer,點擊Search按鈕後在新界面中點擊Create alert。
在新的界面中,根據自己的研究熱點、時間安排等來設置推送的文章內容以及接收頻率。設置完成後點擊save即可。
7
英文期刊查詢
當已知雜誌名稱或者雜誌ISSN號(國際標準期刊編號)時,在Pubmed檢索框分類選項中選擇「NLM Catalog」,在檢索內容框中輸入雜誌名稱(用引號進行限制)或ISSN號,點擊Search進行檢索即可。
當已知某篇英文文章時,以《Surgical treatment of pulmonary tuberculosis:the phoenix of thoracic surgery》為例,可在Pubmed中檢索出該文章後,點擊雜誌名稱J Thorac Dis,此時會跳出自動選擇框,點擊選擇「Search in NLM Catalog」,即可進入雜誌信息頁面。
8
Pubmed神插件
為了直接讓Pubmed直接顯示雜誌的影響因子,可以通過以下兩款神插件——pubmedy和「醫學文獻助手」來實現。將其安裝至瀏覽器後,會在Pubmed搜索界面下直接查看IF、Cited、Citation以及FullText(PDF)/direct pdf等。對於pubmedy插件,目前支持以下8種瀏覽器,一般將插件直接拖入瀏覽器即可。
以Google瀏覽器的安裝為例,如下圖所示:
GIF
9
手機上優雅地使用Pubmed
※2018年,新的生物技術將帶給我們哪些驚喜?
※7節套路課,讓你的臨床研究真正落到實地!
TAG:解螺旋 |