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科學家在蝙蝠體內找到引起仔豬致死性腹瀉疫情的冠狀病毒源頭

近日,中國科學院武漢病毒研究所聯合軍事科學院軍事醫學研究院微生物流行病研究所、華南農業大學、新加坡 DUKE-NUS 新發傳染病研究所和美國生態聯盟(Ecoheath Alliance),確定了2016-2017年造成廣東仔豬場發生仔豬急性致死性腹瀉的病原為一種蝙蝠來源的新型冠狀病毒。研究成果Fatal Swine Acute Diarrhea Syndrome Caused by an HKU2-related Coronavirus of Bat Origin

於北京時間4月5日在線發表在《自然》(Nature)。

2016年10月底,廣東清遠一種豬場暴發仔豬致死性疾病,發病仔豬表現為嚴重急性腹瀉、嘔吐、體重迅速下降,5日齡以下的仔豬死亡率高達90%。其他三個豬場隨後也出現了疫情。截至2017年5月,共造成24693頭仔豬死亡。根據臨床癥狀,研究人員對病豬樣本進行了豬流行性腹瀉病毒、傳染性胃腸炎病毒等已知豬腹瀉相關病毒的檢測。然而在疾病暴發高峰期,所有病毒檢測結果均為陰性,表明該疾病是一種新發疾病。隨後,對腸道樣本的高通量測序結果、病毒分離和感染實驗證實,該疾病的病原是一種冠狀病毒,將其命名為豬急性腹瀉綜合征冠狀病毒,簡稱 SADS 冠狀病毒(swine acute diarrhea syndrome coronavirus, SADS-CoV)。

對 SADS 冠狀病毒的基因組序列分析為尋找病毒的來源提供了線索:SADS 病毒與2007年香港大學首次發現的蝙蝠冠狀病毒 HKU2 基因組序列高度相似,全長序列一致性達95%,但囊膜蛋白(S蛋白)的氨基酸序列一致性只有86%。這表明 HKU2 雖不是 SADS 冠狀病毒的直接祖先,但兩者在遺傳進化上關係相近,暗示 SADS 冠狀病毒來源於蝙蝠。 研究團隊隨即對2013-2016年期間在廣東採集的591份蝙蝠樣品進行了 SADS 冠狀病毒特異性定量 PCR 檢測,共有58份結果為陽性,大部分陽性樣品來自菊頭蝠。其中一株在發生疫情豬場附近的蝙蝠洞穴中發現的冠狀病毒與 SADS 病毒的全基因組序列一致性高達98.48%,其 S 蛋白氨基酸序列一致性在98%以上。結果進一步表明引起這次仔豬腹瀉疫情的 SADS 冠狀病毒來源於蝙蝠 HKU2 相關冠狀病毒的跨種傳播。根據對和病豬有密切接觸的豬場工作人員的血清學調查結果,尚無證據顯示 SADS 冠狀病毒可進一步跨種感染人。

SADS 和2002-2003年暴發的嚴重急性呼吸綜合征(SARS)具有諸多相似之處:兩者均發生於廣東,都由新發冠狀病毒引起,源頭都是菊頭蝠。蝙蝠是多種冠狀病毒的自然儲存宿主。SADS 冠狀病毒的發現與溯源研究證實蝙蝠攜帶的某些冠狀病毒可跨種傳播至家畜並造成嚴重疾病。針對蝙蝠持續開展冠狀病毒的監測,發現、鑒定對人畜健康構成潛在威脅的蝙蝠冠狀病毒,對於防控新發傳染病、保障畜牧業生產安全具有重要意義。

該研究得到了中國科學院先導B科技專項、國家自然科學基金、美國國立衛生研究院等項目資助。武漢病毒研究所研究員周鵬、軍事科學院軍事醫學研究院助理研究員范航、華南農業大學副教授藍天為文章並列第一作者;武漢病毒研究所研究員石正麗,軍事科學院軍事醫學研究院教授童貽剛,華南農業大學教授馬靜雲,新加坡 DUKE-NUS 新發傳染病研究所研究員、澳大利亞技術科學與工程院院士王林發和美國生態聯盟主席(Ecoheath Alliance)Peter Daszak 為共同通訊作者。參加單位還包括泰山醫學院、廣東生物資源應用研究所、武漢大學公共衛生學院、廣東實驗動物監測所和華北科技大學。

SADS 冠狀病毒與蝙蝠 HKU2 相關冠狀病毒的基因組比較(A)和囊膜蛋白 S1 基因進化分析(B)

來源:中國科學院武漢病毒研究所


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