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1013例全外顯子測序研究發現前列腺癌基因突變長尾效應

通過對1013名患者樣本(680例原發性和333例轉移性前列腺腫瘤)的全外顯子測序數據進行分析,研究人員確定了在前列腺癌中發生顯著變異的97個基因,其中有70個基因,未涉及該疾病,包括70之前與前列腺癌沒有關係等基因,如泛素連接酶CUL3和轉錄因子SPEN等。

Credit : Lauren Solomon, Broad Communications

來自Dana-Farber癌症研究所(DFCI)、Broad研究所以及紀念斯隆 - 凱特林癌症中心的研究人員表示,因為這些樣本中包括大量晚期病例 ,所以該研究結果可能解釋了一些預測前列腺癌患者發生轉移的生物標誌物。

該研究於4月2日發表在Nature Genetics雜誌。

前列腺癌是世界範圍內高發和主要的致死癌症之一。不同前列腺癌患者的預後差異較大,部分患者可存活10年之久,但侵襲性前列腺癌患者的存活期一般只有2~3年。且越來越多的證據表明,前列腺癌具有遺傳易感性,與遺傳性乳腺癌、卵巢癌和其他癌症易感性綜合征相關的突變,也可能會增加前列腺癌的風險。

以往的一些研究已經確定了前列腺癌的基因圖譜特徵,鑒別出了許多潛在的癌症驅動基因(如SPOP, FOXA1, TP53, PTEN等)、受影響的細胞通路(如AR, RAS/RAF, PI3K, RB signaling等),以及最為頻發的基因融合事件(TMPRSS2-ERG)等。儘管如此,前列腺癌基因組的異質性表明,更大的WES研究可能會確定更多較低頻率的突變基因,來進一步完善前列腺癌的基因圖譜。

該研究發現,原發和轉移性前列腺癌的平均非同義突變負荷(The mean nonsynonymous mutational load)分別是1.36個/ Mb和2.93個/Mb。與先前報道的相一致,轉移性腫瘤的突變負荷顯著更高。

Most genomic alterations are enriched in metastatic disease

另外,拷貝數負荷(copy number burden )在轉移性腫瘤中也顯著升高。在原發腫瘤中,年齡越大, Gleason得分更高(該評分系統根據不同的病理學表現,分成了5個等級,能體現者前列腺癌患者的生物學特性與預後關係),則意味著更高的非同義突變負荷和拷貝數負荷。

2017年底JCO發布首部針對遺傳性前列腺癌的基因檢測指南共識

確定關鍵驅動基因、正確解讀基因檢測結果、找到新型分子靶向藥物,是腫瘤精準治療的現實路徑。隨著Erleada等靶向藥物獲批和其他藥物,諸如olaparib在前列腺癌治療上的突破,前列腺癌的基因檢測,目前已經在很多的國內外機構開展,包括基於組織和血液樣本的檢測。

目前,市面上的檢測panel的基因列表略有不同,也亟需臨床專家、病理專家、遺傳諮詢師等一起來制定國內的前列腺癌臨床基因檢測共識規範,保證患者能得到最有效的治療。

國外某基於CTC的液體活檢產品:Oncotype DX? AR-V7 檢測?轉移性去勢前列腺癌

總的來說,該分析表明了統一的大樣本基因組分析在單癌種中的應用有很大的意義,該研究重新定義了前列腺癌的分子圖譜。

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回復文字:果然科學,看一篇好玩的科普文。


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