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提高SaCas9胞內剪切活性的方法

基因組編輯技術CRISPR/Cas9在基因功能解析,遺傳病治療,動植物微生物育種等領域得到了廣泛的應用。在進行基因組編輯前,研究者往往需要根據靶位點選擇基因組編輯工具。前間區序列鄰近基序(Protospacer adjacent motif, PAM)在CRISPR/Cas9介導的基因編輯過程中扮演著重要的角色。然而,目前少有研究將注意力放到非典型PAM在人類細胞中對Cas9編輯活性的影響上。

為了解決這個問題,作者構建了雙熒光報告系統,該系統可以用於鑒定功能性的PAM。由於SaCas9(Staphylococcus aureusCas9)編碼序列較最常用的Cas9(SpCas9, Streptococcuspyogenes Cas9)小,在體內基因治療方面具有顯著性的優點,作者利用雙熒光報告系統研究了非典型PAM對CRISPR/SaCas9基因編輯活性的影響。來自多個位點的結果提示SaCas9需要PAM為5"-NNGRRT-3"才能完成高效的基因組編輯。

另一方面,隨著新的基因組編輯工具的出現,可供研究人員選擇的基因組編輯工具也越來越多,但這也給研究者帶來了選擇上的困惑。為此,我們比較了SpCas9、SaCas9和FnCpf1(Francisella novicidaCpf1,最近發現在人類細胞中具有基因組編輯活性)在多個靶位點的基因編輯活性,發現SaCas9在三種基因組編輯工具中活性最高。同時利用eGFP失活實驗驗證了該結果。總之,本研究建立了雙熒光報告系統,可用於識別基因組編輯對應的功能性的PAM,同時利用其可以比較基因組編輯工具的活性。本研究提示,SaCas9在人類細胞中比SpCas9和FnCpf1的基因組編輯活性更高。

相關論文發表在BiotechnologyJournal(DOI: 10.1002/biot.201700561)上。

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