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對33種癌症類型進行深入的基因組分析

美國國立衛生研究院資助的研究人員已經完成了一項詳細的基因組分析,即PanCancer Atlas,該數據集來自10,000多種代表33種癌症類型的腫瘤的分子和臨床信息。

美國國立衛生研究院院長弗朗西斯科林斯醫學博士說:「這個項目是十多年來開創性工作的結晶。「這項分析為癌症研究人員提供了前所未有的關於人類腫瘤如何,何處和為何出現的理解,使得更好的知情臨床試驗和未來治療成為可能。」

PanCancer Atlas在一系列Cell期刊中共收集了29篇論文,總結了由癌症基因組圖譜(TCGA)完成的工作 - TCGA是由國家人類基因組研究所(NHGRI)發起並支持的一項多機構合作)和美國國家癌症研究所(NCI),都是美國國立衛生研究院的一部分。該計劃總資金超過3億美元,涉及北美超過二十多個機構的150名研究人員。

「TCGA是第一個在分子水平上表徵癌症範圍的項目,」卡羅琳胡特博士說,NHGRI基因組科學部門主任兼NHGRI團隊負責人TCGA。「在10年前的這個項目初期,甚至沒有可能做到這一點,更不用說在這樣的範圍內進行正在提出的特徵分析和類型分析,這是一個非常雄心勃勃的計劃。」

「PanCancer Atlas工作是對TCGA近十年來發表的30多篇針對腫瘤的論文的補充,並擴展了2013年發表的早期泛癌研究,」Jean Claude Zenklusen博士,博士, NCI的TCGA計劃辦公室。

該項目不僅關注癌症基因組測序,還關注不同類型的數據分析,如調查基因和蛋白表達譜,並將它們與臨床和影像數據相關聯。

PanCancer Atlas分為三個主要類別,每個類別都以一篇簡要文件為基礎,該文件重述了該主題的核心結果。主要議題包括細胞起源,致癌過程和致癌途徑。多份伴讀報告深入探索這些類別中的各個主題。

在第一篇綜述文章中,作者總結了一組分析的結果,這組分析使用了一種稱為分子聚類的技術,該技術通過諸如正在表達的基因,腫瘤細胞中染色體數目異常和DNA修飾等參數對腫瘤進行分組。該論文的研究結果表明,腫瘤類型可能由其可能的細胞群聚集在一起,這增加了我們對腫瘤組織起源如何影響癌症特徵的理解,並可能導致對各種癌症類型更具體的治療。

第二篇簡要論文對TCGA在導致癌症發展和進展的過程中的發現提供了廣泛的觀點。具體來說,作者指出,這些發現確定了三個關鍵的致癌過程:突變,種系(遺傳)和軀體(後天); 腫瘤基礎基因組和表觀基因組對基因和蛋白質表達的影響; 以及腫瘤和免疫細胞的相互作用。這些發現將有助於優先開發針對各種癌症的新療法和免疫療法。

最後的總結論文詳細介紹了TCGA對控制細胞周期進程,細胞死亡和細胞生長的信號通路的基因組改變的研究,揭示了這些過程在一系列癌症中的相似性和差異性。他們的研究結果揭示了癌症潛在脆弱性的新模式,這將有助於開發聯合療法和個性化醫療。

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