說起來你可能不信，我居然花了兩個小時才裝好一個R包

最新 04-16

不僅僅編譯R語言本身會非常的麻煩，實際上還有些R包為了提高運行速度將一些功能封裝到C/C++中，隨後在安裝的時候會進行編譯。

編譯通過則萬事大吉，如果不通關就是一番折騰。比如說我最近在伺服器上安裝就遇到了這種事情，下面是解決的過程。

並不是所有的warning都可以忽視，比如說如下這種就不行。因為他說DESeq2的編譯結果是「非零返回」，也就是失敗了。而失敗的原因則是前面這個包都失敗了。

那我們逐個解決，使用安裝第一個失敗的包。

上面的報錯信息告訴我們，由於缺少兩個動態庫，xml和iconv，導致編譯不通過。那我們藉助百度去安裝這兩個包，以xml為例

編譯libxml需要Python的頭文件，選擇自己的Python安裝路徑。

安裝完之後，還是無法直接使用R安裝，因為R不知道我們把這些軟體裝在了哪裡。解決方案就是在家目錄下新建一個文件夾，然後在其中創建一個文件.

Makevars的語法和Makefile一致，在編譯的時候裡面的變數會成為編譯工具的參數。

The most common use of a Makevars file is to set additional preprocessor options (for example include paths) for C/C++ filesvia, and additional compiler flags by setting , , or , for C, C++, FORTRAN or Fortran 9x respectively (see Creating shared objects).

由於我的伺服器管理員安裝的工具不多，所以我自己安裝了很多工具，也就有很多的路徑要添加。