大清此衙門技術性最強，也最有特點，很多官員要從民間百姓中選撥

清代的太醫院狹義上理解就是專門給皇帝、后妃、王公大臣看病的機構，可事實上它還負責全國醫務政令的發布以及清宮各大藥房的管理，其職責類似於今天的衛生部。只不過太醫院的級別不高，僅僅是一個正五品的衙門。

雖說太醫院級別不高，但卻是一個技術性很強的機構，裡面有品銜的御醫、太醫都不是通過科舉考試選撥，而是通過另外一種方式進行銓選。按正常渠道，成為御醫的先決條件就是要進入太醫院，成為太醫院的醫官，具備醫官資格，才有可能進宮服務。

太醫院醫官的銓選分兩種情況：一是內部提拔，即在太醫院接受學習的生員中，通過各級考試後擇優錄取；二是從民間醫生之中選擇醫學造詣較高者，經太醫院考核後，選撥任用。

正常情況下，成為太醫院醫官首先就是要進入太醫院教習廳接受醫學教育，進入教習廳的程序也因人而異。和其他行政單位相比，進入太醫院的程序較為簡單，只要有太醫院官員作保，漢人由六品以上的同鄉官員保薦，最後由太醫院官查實其人確實粗通醫書，通曉京語，便可進入太醫院。

進入太醫院後，還需經過面試階段，面試合格者還不能馬上成為正式編製，而是在太醫院掛名，如同現在的實習醫生。然後排隊等待傳其到院，獲取教習廳入學資格。那些沒有獲得正式入學資格的人被稱為「醫生」，能夠入院學習的醫生稱為「肄業生」。

太醫院下所設教習廳，專門教授醫學典籍，傳播醫學知識。教習廳設有教習數人，一般都是從御醫、吏目中選撥而來，入選之人均是精通醫理、品行端正。同治元年（1866年），太醫院教習廳更名為醫學館，相關事宜改由醫學館主持。

進入教習廳學習的肄業生，每年照例還要參加四次考試，考試由太醫院官員主持，考試成績上報禮部記錄在案。三年期滿後，禮部堂官到院主持考試，試題基本出自《素問》、《難經》、《本草》、《脈經》及本科重要方書內。被錄取者將升為醫士；未被錄取者的則繼續學習，等三年後再考。

太醫院的編製自上而下分為院使、院判、御醫、吏目、醫士。和其他衙門所不同的是，太醫院的內部等級制度並不明顯，無論尊卑，都要入宮當值，為皇帝、后妃服務的職責，因此，只要是考中醫士便意味著邁出了御醫的第一步。

根據清代史料記載，太醫院的醫官並非都是太醫院自身培養起來的，有一部分都是從民間考取的。如康熙晚年，太醫院有御醫、吏目等105人，而每天在宮中各處輪值的就需要110人，可謂差多人少，況且太醫院中還管理著宮內眾多的藥房，其人手更是捉襟見肘。

有鑒於此，太醫院採取了應急措施，在各省民醫和在職中下層官員中，選撥精通醫理、情緣效力者，經過考察後予以錄取。效力年久後，照例補授實官。

還有一種情況比較特殊，民間醫生或是通醫之人進入太醫院後，並不入太醫院編製，只是以應召醫生身份在宮內服務，這些人的所有供應都由內務府撥給。一旦出宮後，仍然是從事他們的老本行。

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